我尝试解决这个问题已经很多个月了，这期间我一直在学习pandas。我平时使用SAS工作，它非常适合其支持的外存储功能。但是，SAS由于其他原因而不好用。 有一天，我希望用Python和Pandas替换我的SAS，但目前我缺乏用于大型数据集的外存储工作流程。我说的不是需要分布式网络的“大数据”...

我正试图在Python中从hdf5文件中读取数据。使用h5py，我可以读取hdf5文件，但我无法弄清如何访问文件中的数据。 我的代码import h5py import numpy as np f1 = h5py.File(file_name,'r+') 这样可以工作...

我正在处理大型三维数组，我经常需要以各种方式切片来进行各种数据分析。一个典型的“立方体”可能达到约100GB（未来可能会更大）。 似乎在Python中大型数据集的典型推荐文件格式是使用HDF5（h5py或pytables）。我的问题是：与存储为简单的平面二进制文件相比，使用HDF5存储和分析...

有没有熟练使用 NetCDF 和 HDF5 存储科学数据的经验者，能够对它们进行一些优缺点的比较？ 我使用过 HDF5 并希望通过 Java 进行读写，但是接口本质上是围绕 C 库的包装器，我发现这很令人困惑，因此 NetCDF 看起来很有趣，但我对它几乎一无所知。 编辑：我的应用程序“仅...

关于HDF5性能和并发性，我有以下问题： HDF5支持并发写入吗？ 除了并发考虑因素之外，HDF5在I/O性能方面如何（压缩率是否影响性能）？ 由于我在Python中使用HDF5，它的性能如何与Sqlite相比？ 参考资料： http://www.sqlite.org/faq.ht...

我正在开发一个涉及向文件夹添加元数据的开源项目。提供的（Python）API 可以让你像浏览和访问其他文件夹一样浏览和访问元数据，因为它本质上也是一个文件夹。 \folder\.meta\folder\somedata.json 然后我遇到了HDF5及其衍生物Alembic。在阅读Pyt...

我正在寻找一种使用Python（h5py）将数据追加到现有的.h5文件中的可能性。 我的项目简介：我正在尝试使用医学影像数据训练CNN。由于数据量巨大且在将数据转换为NumPy数组期间占用内存较多，因此我需要将“转换”拆分成几个数据块：加载和预处理前100个医学图像并将NumPy数组保存到h...

我有一个以 hdf5 格式存储的文件。我知道它应该是一个矩阵，但我想在 R 中读取这个矩阵以便进行研究。我看到有一个名为 h5r 的软件包可以帮助解决这个问题，但是我没有找到任何简单易懂的教程。请问是否有在线的教程？具体而言，如何使用此软件包读取 hdf5 对象，并提取矩阵？ 更新 我发现...

给定一个大小为1.5 Gb的pandas数据帧列表，哪种格式最快速地加载压缩数据：pickle（通过cPickle）、HDF5或Python中的其他格式？ 我只关心将数据最快速地加载到内存中 我不关心转储数据，它很慢，但我只需要执行一次。 我不关心磁盘上的文件大小

import pandas as pd dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5') 抛出此错误： "ImportError: HDFStore需要PyTables，"未找到名为tables的模块"的问题" 我尝试安装PyTables，它需要Cython。 我已经安装了Cyt...