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可见性弃用警告...?

我有一些数据,从一个h5文件读取为numpy数组,并进行一些分析。为了背景,这些数据描绘了一个光谱响应曲线。我正在对数据(以及我为x轴创建的后续数组)进行索引,以获取特定值或值范围。我没有执行任何复杂的操作,即使我进行的简单计算也相当基本。但是,我在许多地方遇到以下警告错误: "Visibl...

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h5py无法将元素0转换为hsize_t。

我有一个存储在hdf5文件中的大量图片需要加载和分析。每张图片的大小为1920x1920 uint16,将所有图片一次性加载到内存会导致计算机崩溃。我被告知其他人通过切片图像来解决这个问题,例如如果数据是1920x1920x100(100张图像),则他们读取每个图像的前80行并分析该切片,然后...

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在Python中打开.h5文件

我正在尝试在Python中读取一个h5文件。 这个文件可以在这个链接中找到,它被称为'vstoxx_data_31032014.h5'。我正在尝试运行的代码来自《Python金融大数据分析》一书,作者是Yves Hilpisch,代码如下:import pandas as pd h...

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使用H5Py在HDF5中存储日期时间

我该如何使用h5py将NumPy的日期时间对象存储在HDF5中?In [1]: import h5py In [2]: import numpy as np In [3]: f = h5py.File('foo.hdfs', 'w') In [4]: d = f.create_datas...

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将scipy稀疏矩阵存储为HDF5

我想在HDF5格式中压缩和存储一个巨大的Scipy矩阵。 我该怎么做? 我尝试了以下代码: a = csr_matrix((dat, (row, col)), shape=(947969, 36039)) f = h5py.File('foo.h5','w') dset = f.cr...

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将hdf5文件加载到Python xarrays中

Python模块xarray非常支持加载/映射netCDF文件,甚至可以使用dask进行懒加载。 我需要处理的数据源是成千上万个hdf5文件,其中有大量组、数据集和属性 - 所有这些都是使用h5py创建的。 问题是:如何将hdf5数据(数据集、元数据等)加载到xarray数据集结构中(最好...

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h5py中的压缩文件更大

我将使用h5py库在Python中将numpy数组保存为HDF5格式。最近,我尝试应用压缩,但我得到的文件大小却更大了... 我从这样的内容开始(每个文件都有几个数据集) self._h5_current_frame.create_dataset( 'estimated p...

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错误:构建h5py轮失败。无法构建h5py。错误:无法为需要安装pyproject.toml的项目构建h5py轮。

当我运行以下命令安装tensorflow时,出现了这个错误。python3 -m pip install tensorflow-macos ERROR: Failed building wheel for h5py Failed to build h5py ERROR: Could not b...

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h5py会将整个文件读入内存吗?

h5py会将整个文件读入内存吗? 如果是的话,那么如果我有一个非常非常大的文件会怎么样? 如果不是的话,每次我想要获取单个数据时从硬盘读取数据会很慢吗?我该如何提高速度?

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在 Mac M1 上构建 h5py 失败。

我试图在Python虚拟环境中安装AlphaFold。在安装依赖项时,我遇到了以下错误: ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement tensorflow==1.14 (from versions: n...