有没有人知道如何从lme4的mer对象中生成漂亮的出版质量LaTeX表格?无论是xtable方法(包xtable)还是latex方法(包Hmisc),都不知道如何处理mer对象。例如,给定以下拟合:library(lme4) fm1 <- lmer(Reaction ~ Days...
我想使用update()函数更新模型的随机部分,特别是添加一个随机效应。大多数例子(help("update"),help("update.formula"),lme4:用 R 进行混合效应建模)都关注于模型的固定部分。在下面的示例中,如何使用update()从fm0到fm1? librar...
我可以使用nlme包中的gls()函数来建立没有随机效应的mod1模型。 然后,我可以使用lme()函数来建立包含随机效应的mod2模型,并通过AIC对比mod1和mod2。 mod1 = gls(response ~ fixed1 + fixed2, method="REML", data...
我想知道如何使用lme4拟合多元线性混合模型。我已经使用以下代码来拟合单变量线性混合模型:library(lme4) lmer.m1 <- lmer(Y1~A*B+(1|Block)+(1|Block:A), data=Data) summary(lmer.m1) anova(lmer....
我正在尝试在最新版本的R和lme4上重新运行一份旧的数据分析报告,其中包括二项式glmer模型(来自2013年初),因为我已经不再有旧版本的R和lme4。然而,我遇到了与dmartin和carine以前的帖子中类似的警告信息(第一个警告信息),以及其他stack overflow之外的帖子中的...
我希望能够将一个命名的模型列表(merMod对象)传递给anova()函数,并在输出中保留模型名称。这在使用mclapply()并行运行一批缓慢的模型(如glmer)时特别有用。我想到的最好方法是对模型列表进行去命名处理,然后使用do.call,但这并不理想,因为我的模型可能会被命名为“mod...
我正在使用glmuiti在R中进行模型平均。我的模型中有约10个变量,因此无法进行全面的筛选 - 因此我需要使用遗传算法(GA)(调用:method="g")。 我需要包括随机效应,因此我使用glmuiti作为lme4的包装器。这里提供了执行此操作的方法:http://www.inside-...
我想分享一些关于如何使用lme4软件包在R中改进线性混合效应模型拟合时间的想法。 数据集大小:该数据集大约有400,000行和32列。不幸的是,无法透露数据的性质。 假设和检查:假定响应变量来自正态分布。在模型拟合过程之前,使用相关表和alias函数检查变量是否存在共线性和多重共线性。 ...
我正在尝试预测随时间变化(x轴上的天数)我的二项数据上运行的glmer模型的值。Total Alive和Total Dead是计数数据。这是我的模型以及相应的步骤: full.model.dredge<-glmer(cbind(Total.Alive,Total.Dead)~(CO2....
我正在R中运行一个广义线性混合模型,用于二元响应变量,但是出现了错误信息。 我的代码如下: library('lme4') m1<-glmer(data=mydata, REPRODUCE~F1TREAT*SO+(1|LINE/MATERNAL_ID), family=binomia...