HDBSCAN参数之间的区别
我对HDBSCAN中以下参数的区别感到困惑： 1. min_cluster_size 2. min_samples 3. cluster_selection_epsilon 请纠正我，如果我有误的话。 如果将min_samples设置为7，则形成的聚类需要具有7个或更多点。对于clust...
在网络中生成不同的节点组
问题 给定以下节点和边的网络，我希望得出所有可能的节点分组，其中每个组内的所有节点都通过边与该组内的所有其他节点相连。 在这个网络中... 节点'B'、'C'和'F'将成为一组，因为它们之间完全互相连接。 'A'只能与自己形成一组。 'D'和'B'将组成一组，但是'D'不会和'B'...
如何在R中进行聚类分析而不移除包含NA值的行。
我有一组数据，其中一些元素的值是NA。 我的目标是在不删除包含NA的行的情况下进行聚类。 我知道daisy中的gower距离测量可以允许这种情况。 但为什么我的下面的代码不起作用呢？ 如果有其他替代方案，我也欢迎。 # plot heat map with dendogram togeth...
如何通过接近度将对象分组到一个集合中？
我有一个包含数千个地址的集合。如果我可以获取每个地址的经纬度，如何按照接近程度将该集合分成组？ 此外，我可能希望根据不同规则重新尝试“聚类”： N组 每组M个地址 组内任何地址之间的最大距离
在进行双向聚类（行和列）后，如何在heatmap.2中添加ColSideColors?
我有以下的代码： library(gplots) library(RColorBrewer); setwd("~/Desktop") mydata <- mtcars hclustfunc <- function(x) hclust(x, method="complete") ...
如何在R中的散点图上叠加饼图？
我想使用R替换2D散点图中的数据点，并显示附加值的饼图。 我的思路是，我有来自生物实验的数百个元素（蛋白质）的时间序列数据，监测了4种情况。 我想在y轴上绘制元素（分类数据），在x轴上绘制事件在时间上的发生。为了以饼图或甜甜圈图的形式可视化4个条件之间的相对出现率，我想将其覆盖到散点图中的相...
在Matlab中查找具有高交叉相关矩阵的组
给定一个下三角矩阵(100x100)，它包含交叉相关值，其中条目“ij”是信号“i”和“j”的相关值，因此高值意味着这两个信号属于相同的对象类别。已知数据集中最多有四个不同的类别，是否有一种快速有效的方法来对数据进行分类，并将所有信号分配到4个不同的类中，而不是搜索和交叉检查所有条目？以下7x...
映射应用的聚类算法
我在研究对地图上的点（纬度/经度）进行聚类。有没有适合快速、可扩展的算法推荐？ 更具体来说，我有一系列的纬度/经度坐标和一个地图视口。我想要聚类在一起的接近的点，以便去除杂乱。 我已经有一个解决方案（请参见此处），只是我想知道是否有任何正式的算法可以有效地解决这个问题。
使用Levenshtein距离进行文本聚类
我有一组（2k - 4k）小字符串（3-6个字符），想要对它们进行聚类。由于使用了字符串，之前在如何进行聚类（特别是字符串聚类）中的答案告诉我，Levenshtein距离是用作字符串距离函数的好方法。而且，由于我事先不知道聚类的数量，层次聚类是正确的选择，而不是k-means。 尽管我理解了...
如何在R中更改树形图标签
我在R中有一个树状图。它基于使用hclust进行的分层聚类。我正在使用不同的颜色着色不同的标签，但是当我尝试更改我的树状图的标签（为集群所基于的数据框的行）时，使用dendrogram = dendrogram %>% set("labels", dataframe$column)，标签...