在Ubuntu上从CRAN安装lme4

Question

我在Ubuntu 18.04上安装CRAN的lme4包时遇到了问题。我在R 3.4.4上运行install.packages("lme4")并收到以下错误：

ERROR: configuration failed for package ‘nloptr’
* removing ‘/home/peter/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/nloptr’
ERROR: dependency ‘nloptr’ is not available for package ‘lme4’
* removing ‘/home/peter/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/lme4’

仔细观察，我看到了这两行错误：

libtool: link: ERROR: no information for variable 'AR' cru .libs/libutil.a .libs/mt19937ar.o .libs/sobolseq.o .libs/timer.o .libs/stop.o .libs/redblack.o .libs/qsort_r.o .libs/rescale.o

checking for ranlib... ERROR: no information for variable 'RANLIB'

但是，在我的电脑上，ar和ranlib命令都可以工作。造成这些错误的原因可能是什么？

- pete

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我正在与相同的问题苦苦挣扎。您找到解决方法了吗？当我尝试从R而不是R Studio安装lme4包时，它会说c++编译器不起作用；现在我正在猜测错误指的是哪个编译器。 - Ben Bolker

你尝试过按照 CRAN 上 Ubuntu 的说明安装二进制版本的软件包吗？链接：https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README.html - Ben Bolker

PS https://launchpad.net/~marutter/+archive/ubuntu/c2d4u 有适用于 R < 3.5 的二进制包，但除非您需要早期版本，否则安装更近期的 R 版本可能更值得（您可以通过上一条评论中的链接轻松完成）。 - Ben Bolker

根据我的经验，在Ubuntu 22.04上使用R 4.2.2时，我们缺少nlopt，可以在终端中通过sudo apt-get install libnlopt-dev来解决。然后就可以编译了。 - Quar

Answer 1

您只需安装较旧版本的nloptr包。

例如：

packageurl<-"https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/nloptr/nloptr_1.2.1.tar.gz"

install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

我猜你正在使用R 3.X版本。这种错误是由于软件包更新以支持R 4.0所导致的。

- YWu

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这对我很有用。install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source");``` 注：以上为R语言代码，内容为安装nloptr（非线性优化包）的指令。 - mmoisse

@mmoisse 谢谢！我正在处理一个使用 R 3.5.1 的工作机器上的 bug，而您的评论帮了我大忙 :) - ialm

Answer 2

终于我找到了答案。我在Ubuntu 18.04中安装ggpubr包时遇到了困难。这个答案解决了依赖问题。

- PedroZM

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