从CRAN中移除的软件包安装

Question

我正在使用 R 编程语言。我试图安装“Data Mining with R”（DMwR）包。然而，当我访问 CRAN 网站 时，它似乎已经消失了:

Package ‘DMwR’ was removed from the CRAN repository.
Formerly available versions can be obtained from the archive.
Archived on 2021-03-16 as check problems were not corrected despite reminders.
A summary of the most recent check results can be obtained from the check results archive.

我访问了 Github 页面 这个包

然后，我尝试直接从 Github 安装此软件包：

> library(devtools)

Loading required package: usethis
Warning message:
package ‘usethis’ was built under R version 4.0.5 

> install_github("Luis Torgo/DMwR")

Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub:
  JSON: EXPECTED value GOT <

但这也不起作用。有人能请教我如何安装这个软件包吗？

- stats_noob

Answer 1

除了从CRAN软件源安装外，另一个选择是：

remotes::install_version("DMwR", version="0.4.1")

• 对于这种方法，你需要在存档目录中查找最新版本（如果你想编写代码，可能可以进行网络爬取）。
• 与remotes::install_github("cran/<package>")一样，你将从源代码安装，这意味着如果包或其任何依赖项有已编译的组件（在此情况下似乎没有），则需要在系统上安装开发工具（编译器等）。

快速提醒：

• 如果包最近被归档，并且归档的原因是因为CRAN维护者很挑剔（这是他们的权利），那么这种方法将有效；
• 然而，由于上次更新以来，包可能已经与当前R生态系统（R版本、依赖项）不兼容——在这种情况下，你可能会发现自己陷入了依赖地狱，试图安装它（或者更糟的是，你的结果可能不可靠）。

- Ben Bolker

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谢谢您的回复！这似乎起作用了！ - stats_noob

如果其中任何一个答案解决了您的问题，我们鼓励您点击复选标记来接受它。 - Ben Bolker

@BenBolker 我也遇到了同样的问题，你的回答帮了我很大忙。现在我只有一个问题：如何加载这个包？library()或者require()都不起作用。我的代码是：remotes::install_version("zeligverse", version="0.1.1")和require(zeligverse)。 - rr19

你可能需要在一个单独的问题中发布这个。我猜测有多个缺失的包。如果你将其作为一个单独的问题发布，请确保明确指定“不起作用”是什么意思（即，你得到了什么错误消息？） - Ben Bolker

Answer 2

我在 R 4.1.0 上看到了同样的信息。

install.packages("DMwR")
Warning message:
package ‘DMwR’ is not available for this version of R

另一种选择是创建一个checkpoint。根据CRAN软件包网站的说法，它在“2021-03-16”被归档。因此，我们可以使用该日期之前的 checkpoint。

library(checkpoint)
checkpoint("2021-03-15")
install.packages("DMwR")
library(DMwR)
#Loading required package: lattice
#Loading required package: grid
#Registered S3 method overwritten by 'quantmod':
#  method            from
#  as.zoo.data.frame zoo 

检查点也可以被删除

delete_all_checkpoints()

- akrun

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很好，这也提供了二进制文件（不像其他方法）。 - Ben Bolker

Answer 3

你可以从 CRAN Github 镜像安装它（尽管它已经从 CRAN 中移除），例如：

library(devtools)
install_github("cran/DMwR")

- jared_mamrot

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谢谢您的回复！当我输入您的代码时，我得到了以下结果：> remotes::install_version("DMwR", version="0.4.1") 从以下网址下载软件包：https://cran.rstudio.com//src/contrib/Archive/DMwR/DMwR_0.4.1.tar.gz 这些软件包有更新版本可用。 建议更新所有软件包。 您想要更新哪个？1：全部
2：仅CRAN软件包
3：无
4：bitops (1.0-6 -> 1.0-7) [CRAN] 5：gtools (3.8.2 -> 3.9.2) [CRAN] 6：curl (4.3 -> 4.3.1) [CRAN] 7：zoo (1.8-8 -> 1.8-9) [CRAN] - stats_noob

我输入了“3”，但最终，“DMwR”库没有出现在R studio的软件包列表中。我想知道为什么？ - stats_noob

我更新了所有过时的软件包（只有我的系统上的gtools），并且安装没有出现错误。但是@BenBolker的解决方案似乎已经奏效了，很高兴你解决了这个问题 :) - jared_mamrot

谢谢大家的帮助！ - stats_noob

Answer 4

该软件包是为2010年出版的一本书提供支持的。作者于2017年出版了第二版，目前的支持软件包版本为https://cran.r-project.org/web/packages/DMwR2/index.html

该软件包目前已有CRAN托管的源代码和二进制软件包，无需编译，因此可以使用以下命令进行安装：

install.packages("DMwR2", dependencies=TRUE)

您可以按照Github网站上的说明获取最新版本：

library(devtools)  # You need to install this package!
install_github("ltorgo/DMwR2",ref="develop")

这些更有可能在最新版本的R中正常运行。

- IRTFM

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谢谢您的回复！我尝试安装了“DMwR2”库 - 它成功安装了！但我需要从“DMwR”库中使用的函数在“DMwR2”库中缺失（例如，SMOTE()函数）。https://www.rdocumentation.org/packages/DMwR/versions/0.4.1/topics/SMOTE - stats_noob

如果这是唯一缺失的算法，并且它不依赖于早期包中的其他函数，您可以将其复制到您的DMwr2版本中。如果它确实依赖于其他函数，则应该会出现有信息的错误，然后您可以将它们一起复制。 - IRTFM