在R中安装lme4包出现问题

Question

我在安装lme4包时遇到了问题。 install.packages("lme4")会发出以下警告。当我尝试加载lme4时，R说它不存在。有人知道如何解决这个问题吗？

also installing the dependency `nloptr`

Warning message in install.packages("lme4"):
“installation of package ‘nloptr’ had non-zero exit status”
Warning message in install.packages("lme4"):
“installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status”
Updating HTML index of packages in '.Library'
    
Making 'packages.html' ... done

- jean10

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你可以运行 install.packages("nloptr") 并将完整输出复制粘贴到你的问题中吗？另外，看看 sessionInfo() 的输出也会有所帮助。你可以在这里找到相关线程 here。你可能只需要安装或更新 CMake，但如何做到平台依赖性。 - Mikael Jagan

Answer 1

你应该考虑执行sudo apt install r-cran-lme4，因为lme4当然是每个Debian和Ubuntu的一部分，自2004年以来就一直存在。这当然包括它的依赖项，例如nloptr从2014年开始就存在于Debian和Ubuntu中。（声明：我为Debian维护两者）。

更一般地说，你也可以考虑使用Ubuntu的二进制文件。昨天我回答了一个类似的问题，附有漂亮的“gif视频”，介绍了如何从r2u存储库中安装gmm软件包及其20,000个适用于Ubuntu的CRAN二进制文件。

- Dirk Eddelbuettel

Answer 2

lme4 正在尝试安装一个依赖项 nloptr，nloptr 需要安装一个名为 cmake 的外部依赖项，这可能是导致 lme4 安装失败的原因。

如果您捕获了软件包安装的错误，您可能会看到类似于以下内容：

CMake was not found on the PATH. Please install CMake:

 - sudo yum install cmake          (Fedora/CentOS; inside a terminal)
 - sudo apt install cmake          (Debian/Ubuntu; inside a terminal).
 - sudo pacman -S cmake            (Arch Linux; inside a terminal).
 - sudo brew install cmake         (MacOS; inside a terminal with Homebrew)
 - sudo port install cmake         (MacOS; inside a terminal with MacPorts)

Alternatively install CMake from: <https://cmake.org/>

您可以根据您的操作系统尝试上述选项之一。

- iquestionshard