获取n个节点之间最短路径的子图
我有一个无权图，想要获取一个子图，其中只包含n个已知节点之间的最短路径所包含的节点和边。在这种情况下，有3个节点（名称为11、29和13）。 问题 如何在R中获取n个节点之间的最短路径的子图？ MWE library(ggraph) library(igraph) hs <- ...
增加igraph节点之间的距离
我有一个使用igraph生成的图形。我想将节点分散开来。到目前为止，我找到的唯一方法是缩放布局并强制绘制命令不重新缩放。png("kmeansColouredNetwork.png", width=1200,height = 1000) col=c("yellow", "saddlebrown...
快速获取父元素的所有子代的方法
以下是与父子关系相关的数据框: parent_id child_id 1 1 2 2 2 3 3 3 4 目标是实现以下内容，即扩展先前数据框的版本，其中所有后代（子女、孙子女等）都分配给每个父...
如何在R中绘制二分图
我该如何在R中绘制二分网络类型的网络？类似于这个： 我有类似的数据，但是有基因、疾病和SARS的权重。这个网络是一个例子。我有不同种类的属性。我在这里遵循了链接。但由于我的知识水平有限，我无法从中获得太多帮助。提前感谢任何帮助。
如何从边列表创建加权邻接表/矩阵？
我的问题很简单：我需要从边的列表中创建一个邻接表/矩阵。 我在csv文件中存储了一个边列表，其中column1 = node1，column2 = node2，并且我想将其转换为加权邻接表或加权邻接矩阵。 更具体地说，数据的形式如下 - 数字仅是节点ID：node1,node2 551,5...
在Python中使用igraph进行社区检测，并将每个节点的社区编号写入CSV。
我有一个网络，想使用igraph中的edge_betweenness社区检测算法进行分析。我熟悉NetworkX，但尝试学习igraph，因为它比NetworkX具有更多的社区检测方法。 我的最终目标是运行edge_betweenness社区检测，并找到最优数量的社区，并编写一个CSV文件，其...
如何在igraph中将边缘标签与边缘分离？
我想移动边缘标签的位置，使其不在顶部。 这里有一个小例子： g <- graph.empty(n=3) g <- graph(c(1,2,3,2,1,3), directed=T) E(g)$weight <- c(3,2,5) plot(g, edge.lab...
安装python-igraph失败
我正在尝试安装python-igraph。运行sudo pip install python-igraph后，我得到了以下日志：Downloading/unpacking python-igraph Downloading python-igraph-0.7.1-1.tar.gz (375...
在Python中绘制图形时，如何处理大量的边缘？
我有以下脚本：import pandas as pd from igraph import * df_p_c = pd.read_csv('data/edges.csv') ... edges = list_edges vertices = list(dict_case_to_numbe...
使用数据表或igraph按组查找相邻的节点
我有一个data.table：groups <- data.table(group = c("A", "B", "C", "D", "E", "F", "G"), code_1 = c(2,2,2,7,8,NA,5), ...