Scikit-learn凝聚聚类链接矩阵
我正在尝试绘制一个完全链接的 scipy.cluster.hierarchy.dendrogram，并发现scipy.cluster.hierarchy.linkage比sklearn.AgglomerativeClustering慢。 然而，sklearn.AgglomerativeClu...
如何在R中更改树形图标签
我在R中有一个树状图。它基于使用hclust进行的分层聚类。我正在使用不同的颜色着色不同的标签，但是当我尝试更改我的树状图的标签（为集群所基于的数据框的行）时，使用dendrogram = dendrogram %>% set("labels", dataframe$column)，标签...
在R中绘制水平树状图时，为聚类结果添加矩形框并裁剪树枝。
我正在尝试使用R绘制层次聚类的结果作为树状图，并用矩形标识聚类。以下代码可以绘制垂直树状图，但对于水平树状图（horiz=TRUE），矩形不会被绘制。是否有办法也可以在水平树状图中绘制矩形呢？ library("cluster") dst <- daisy(iris, metric =...
如何在树状图上删除标签？
我该如何删除这个图表中的所有标签？或者，更好的方法是，如何让它更易读？ 我使用以下命令创建了它： plot(hclust(distance), main="Dissimilarity = 1 - Correlation", xlab= NA, sub=NA) 我已经多次阅读过，实际上 ...
在R中制作带有标签的水平树状图
我希望通过hclust函数的输出绘制一棵谱系树。我希望这个谱系树是水平排列而不是默认的垂直排列，可以通过以下方式实现（例如）：require(graphics) hc <- hclust(dist(USArrests), "ave") plot(hc) 我尝试使用as.dendrogra...
d3中带有肘连接的树形图/树状图
我对d3.js（以及SVG）非常陌生，想做一些简单的事情：用倾斜的连接器绘制树/树状图。 我利用了这里的d3示例：http://mbostock.github.com/d3/ex/cluster.html 并希望将它更像这里的protovis示例： http://mbostock.git...
使用Python手动绘制树状图
我已经实现了一个算法来解决图中聚类问题。我使用Python库“python-graph”来表示图形。现在，在我的计算的每个步骤（算法是迭代的）中，我必须绘制树状图的一部分。事实上，该算法是分裂的，从原始图计算出聚类。现在，我不知道用什么来绘制树状图（有人建议使用PIL，但我正在寻找一些简单易用...
如何可视化（树状图）一个包含层级项的字典？
这是我第一次使用Python从字典格式的分层数据中进行可视化。数据的最后一部分如下： d = {^2820: [^391, ^1024], ^2821: [^759, 'w', ^118, ^51], ^2822: [^291, 'o'], ^2823: [^25, ^64], ^2824:...
树形、聚类、径向树形和径向聚类布局之间的平滑过渡
为了一个项目，我需要交互式地更改可视化的分层数据布局——丝毫不改变底层数据。可以在树形、簇形、径向树形和径向簇形布局之间切换。过渡最好是动画。 我认为可以用 D3 完成这个相对容易的任务。我开始尝试，但我迷失在旋转、数据绑定和类似的操作中，所以我请求你的帮助。而且，可能我做的不符合D3的精神...
从seaborn clustermap中提取聚类
我正在使用seaborn clustermap创建聚类图表，视觉效果很好（此示例生成非常相似的结果）。 但是，我无法找出如何编程提取这些聚类。例如，在示例链接中，我该如何找到1-1 rh、1-1 lh、5-1 rh和5-1 lh形成了一个好的聚类？在视觉上很容易，但我试图使用查看数据和树状图...