hclust函数的聚类列表
使用plot(hclust(dist(x)))方法，我能够绘制聚类树图。它能正常运行。但是我想获得所有聚类的列表，而不是树形图，因为我的数据量非常大（例如150K个节点），绘图会变得混乱。 换句话说，假设a b c是一个聚类，d e f g是一个聚类，那么我希望得到这样的内容：1 a,b,c ...
在R中制作带有标签的水平树状图
我希望通过hclust函数的输出绘制一棵谱系树。我希望这个谱系树是水平排列而不是默认的垂直排列，可以通过以下方式实现（例如）：require(graphics) hc <- hclust(dist(USArrests), "ave") plot(hc) 我尝试使用as.dendrogra...
如何在R中使用'hclust'函数进行聚类分析
我试图构建聚类方法的函数有以下几种方式： mydata <- mtcars # Here I construct hclust as a function hclustfunc <- function(x) hclust(as.matrix(x),method="complet...
在heatmap.2中设置距离矩阵和聚类方法。
heatmap.2默认使用dist来计算距离矩阵和hclust来进行聚类。有没有人知道如何将dist设置为使用欧几里德方法，而将hclust设置为使用质心方法？我在下面提供了一个可编译的代码示例。我尝试了distfun = dist（method =“euclidean”），但那行不通。有什么...
在R中去除树状图的x轴标签
我使用 xlab="" 来抑制 x 轴标签，但在我的树状图中仍然会得到一个“子 x 轴标签”。如何删除它并去除树状图下方的任何额外空间？require(graphics) hc <- hclust(dist(USArrests), "ave") plot(hc,xlab="")
在R 3.01中更改聚类树状图的标签大小
有人找到了解决 R 3 中集群树标签大小不能改变的问题的方法吗？ 在更新 R 到 3.01（之前版本可能是 2.15）之前，以下代码原本可以正常工作：plot(hclust, labels = data[, 1], cex = 0.3) 现在改变 cex 参数时，标签大小不会发生改变。
我该如何在R树状图中正确地为边缘着色或绘制矩形？
我使用了R的hclust()、as.dendrogram()和plot.dendrogram()函数来生成this dendrogram。 我使用了dendrapply()函数和一个本地函数来给叶子着色，目前效果良好。 我有一些统计测试的结果，可以表明一组节点（例如树的右下角的“_+v\_...
在R中绘制水平树状图时，为聚类结果添加矩形框并裁剪树枝。
我正在尝试使用R绘制层次聚类的结果作为树状图，并用矩形标识聚类。以下代码可以绘制垂直树状图，但对于水平树状图（horiz=TRUE），矩形不会被绘制。是否有办法也可以在水平树状图中绘制矩形呢？ library("cluster") dst <- daisy(iris, metric =...