R笔记本除了实际绘图外还生成了一个空白的绘图

Question

我正在使用R笔记本。这是我的代码块：

```{r}
test = matrix(rnorm(200), 20, 10)
pheatmap::pheatmap(test)
```

我猜这是由于pheatmap生成图的方式，但实际上它首先会生成一个空白的图。因此，这是我看到的输出: 如何消除第一张图片？我在RStudio输出中看到它（如上面的截图）并且在.nb.html文件中也能看到。如果我编织到HTML，空白图就不会出现。

我尝试了不同的fig.keep选项。当我编织到HTML时，它们有效，但似乎在.nb.html文件中没有效果。如何消除它？

更新：此问题已在pheatmap中得到解决。它可能仍适用于其他情况。

- burger

Answer 1

这很奇怪。试试这个：

```{r}
library(pheatmap)
p <- pheatmap(test, silent = TRUE)
plot(p$gtable)
```

它会准确地生成你所描述的内容。现在，将其分成两个部分。

```{r}
library(pheatmap)
p <- pheatmap(test, silent = TRUE)
```

```{r}
plot(p$gtable)
```

它管用了！虽然我不知道为什么。

- Dan

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对我来说也可以。实际上，输出略有不同。例如，使用 plot(p$gtable) 会得到一个灰色背景。 - burger

@burger 你可以通过执行 grid.draw(p$gtable) 而不是 plot(p$gtable) 来获得白色背景。 - tuomastik