如何防止Matplotlib裁剪我的坐标轴标签？

Question

我正在为一篇科学论文准备一些图表，需要宽而短以适应页面限制。然而，当我将它们保存为pdf时，x轴标签丢失了，因为（我认为）它们在边界框外部。

将以下内容放入iPython笔记本可以重现问题。

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf")

生成的pdf文件如下所示： 如何更改pdf文件的边界框？理想情况下，我希望有一个“正确”的解决方案，即自动调整大小，使所有内容都整齐地适合其中，包括去除左右两侧的不必要空间 - 但我很匆忙，所以我会接受任何一种方法来更改边界框，如果必须的话，我会猜测数字直到它看起来正确为止。

- N. Virgo

Answer 1

通过谷歌搜索后，我找到了答案：你可以在savefig命令中加入bbox_inches='tight'参数，它将自动调整边框大小以适应内容的尺寸：

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf",bbox_inches='tight')

这些英寸太紧了，我想。

请注意，这与Ffisegydd的答案略有不同，因为它将边界框调整到绘图中，而不是将绘图调整到边界框。 （但对于我的目的，两者都可以。）

- N. Virgo

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对于那些已经设置了样式表（我建议每个人都这样做，参见文档，它会改变你的生活），您可以将savefig.bbox参数设置为tight（而不是standard）。要使plt.show()和plt.savefig()获得相同的结果，还需将figure.autolayout参数设置为True（默认值为False）。 - Vegard Gjeldvik Jervell

Answer 2

你可以使用plt.tight_layout()来调整matplotlib绘图的布局。 tight_layout()会自动调整尺寸，并且在标签/刻度等重叠时也可以使用。请参考tight_layout指南。

%pylab inline

pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)

plot([1,5,2,4,6,2,1])

xlabel("$x$")
ylabel("$y$")

tight_layout()

savefig("test.pdf")

这里是输出的 .png 文件（无法上传 pdf 到 Stack Overflow，但我已经检查过它并且 pdf 的工作方式与此相同）。

- Ffisegydd

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我接受这个答案，但任何未来的访问者可能也会对我的答案感兴趣，该答案将边界框调整为适合绘图，而不是相反。 - N. Virgo

Answer 3

如果你正在为一篇科技论文准备内容，我建议你自己进行“剪辑”，使用...

plt.subplots_adjust(left,right,bottom,top,..)

在创建图形后，在保存之前使用 subplots_adjust 来调整边距，如果你是从 ipython 控制台运行程序，也可以在生成图形后调用该函数，并通过试错方法来调整边距。某些后端（我认为至少 Qt 后端）还会提供此功能的 GUI。

手动调整需要时间，但在我的经验中，大多数情况下可以提供更精确的结果，特别是在 Latex 渲染时。

这是当你必须将两个图形垂直或水平堆叠在一起时的唯一选择（例如使用 subfigure 等软件包），因为 tight_layout 不能保证两个图形具有相同的边距，而且轴会在纸上对齐不准。

这是一个关于使用 matplotlib 进行出版物的不错的链接，涉及如何设置图形宽度以匹配期刊栏宽。

- gg349

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谢谢，那个链接非常有帮助。 - N. Virgo