在MacOS上安装rpy2

Question

我一直在尝试在MacOS Sierra上为Python 3.6安装RPy2，但pip安装过程未经编译就失败了。

安装时出现以下错误信息：

  clang: error: unsupported option '-fopenmp'
  error: command 'clang' failed with exit status 1

任何关于安装的帮助将不胜感激。

- zenofsahil

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这在2020年仍然发生。 - WestCoastProjects

Answer 1

在这个线程中找到了解决方案。

env CC=/usr/local/Cellar/gcc/X.x.x/bin/gcc-X pip install rpy2

通过将上述命令中的gcc版本替换为您机器上的最新版本即可解决该问题。例如，在我的Mac上，我运行了以下命令：

env CC=/usr/local/Cellar/gcc/8.2.0/bin/gcc-8 pip install rpy2

- zenofsahil

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这个方法在众多所谓的解决方案中最终对我起作用了。非常感谢。 - Coolio2654

Answer 2

如果使用Miniconda环境，则可以这样操作： conda install -c r rpy2 来自于: https://anaconda.org/r/rpy2

• macOS Mojave

• Python 3.8

- alejandro

Answer 3

如果您已经安装了Python包wheel，那么pip install应该可以获取OS X的预编译二进制文件。

- lgautier