R，通过dfSummary生成漂亮的图表

Question

我在使用summarytools包时遇到了问题。这里有一个教程：https://cran.r-project.org/web/packages/summarytools/vignettes/Introduction.html，其中有漂亮的数据图表: 我的问题是，我的代码只生成了文本图形。这是我在markdown中用来生成图表的代码块:

```{r summary, results='markup'}
library(summarytools)
my_data <- ...
dfSummary(my_data)
```

很不幸，它生成了像这样的内容： 如何使用summarytools生成漂亮的报告呢？ 或者你有更好的工具吗？（生成图表、平均值、标准差等）

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我找到了正确的语法来生成图表：

print(dfSummary(baseline_train), method = 'render')

结果看起来像这样：

- CezarySzulc

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使用 dput 传输数据而非图片。 - NelsonGon

从您提供的文档中可以看到：“也可以在Rmarkdown文档中使用dfSummary()。在下一个示例中，请注意，由于rmarkdown兼容性问题，直方图不会显示。”；语法应为dfSummary(my_data, plain.ascii = FALSE, style = "grid")以显示HTML表格（不包括直方图）。 - Maurits Evers

@MauritsEvers 我尝试了这个语法，结果仍然是一样的。 - CezarySzulc

@NelsonGon 关于数据，我们可以尝试使用ggplot2中的钻石数据集。 - CezarySzulc

@Cezary.Sz 你需要使用 results = 'asis' 而不是 results = 'markup'，请参见我下面的答案。 - Maurits Evers

Answer 1

这方面的小更新:

• 始终使用knitr块选项results='asis'，就像之前某位评论所指出的那样。

• 可以使用print()生成包括png图形的摘要:

  print(dfSummary(iris), method = "render")
  
  
  

• 从0.9.0版本开始（仅在2019年2月之后才在GitHub上提供），markdown摘要也将包括提供png图形，只要您指定以下参数:

  • plain.ascii = FALSE
  • style = "grid"

  • 临时png的物理位置（tmp.img.dir）

    dfSummary(iris, plain.ascii = FALSE, style = "grid", tmp.img.dir = "/tmp")

其他提示

• 在两种情况下，您（很可能）需要使用dfSummary()的graph.magnif参数调整图形的大小（尝试值介于.75和.85之间）。
• 排除一两列以避免过于宽泛的摘要：
  dfSummary(iris, [...], varnumbers = FALSE, valid.col = FALSE)

- Dominic Comtois

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能否将结果以 MS Excel 表格的形式呈现？ - NCC1701

函数生成的表格是一个数据框，因此您可以尝试使用其中一个能够导出到Excel的众多软件包之一（例如xlsx）。但是PNG图形将会丢失，格式很可能需要手动调整。 - Dominic Comtois

Answer 2

您需要在代码块中使用results = 'asis'。这是一个最小可重现的示例：

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title: "Untitled"
output: html_document
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```{r, results='asis'}
library(summarytools)
dfSummary(iris, plain.ascii = FALSE, style = "grid")
```

生成

- Maurits Evers

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你生成了文本图。我不需要它。我需要图形。 - CezarySzulc

@Cezary.Sz 请再次阅读我的评论（以及小品文）。后者非常清楚地说明了在RMarkdown文档中使用dfSummary时不会生成直方图。此外，上面的表格不是纯文本（就像您的示例一样），而是一个HTML表格。 - Maurits Evers