如何在R中创建分组箱线图？

Question

我希望将三个数据集合并，并获得仅有两个框的图表，1个代表A，1个代表B。您能建议如何实现吗？

我正在尝试在R中创建分组箱线图。我有2个组：A和B，在每个组中，我有3个子组，每个子组有5个测量值。

以下是我构建箱线图的方法，但如果有更好、更短或更容易的方法，请告诉我，谢谢。

A1 <- c(1,2,9,6,4)
A2 <- c(5,1,9,2,3)
A3 <- c(1,2,3,4,5)
B1 <- c(2,4,6,8,10)
B2 <- c(0,3,6,9,12)
B3 <- c(1,1,2,8,7)

DF <- data.frame(A1, A2, A3, B1, B2, B3)

boxplot(DF, col = rainbow(3, s = 0.5))
axis(side = 1, at = c(2,5), labels = c("A","B"))
legend("topleft", fill = rainbow(3, s = 0.5), legend = c(1,2,3), horiz = T)

我该如何正确地将A和B中的方框（联合）分组，并将轴标题固定为简单的A和B，就像我尝试过的那样？

我想要的是类似于：

- Daniel Valencia C.

Answer 1

当数据以长格式而不是宽格式存在时，像这样分组会更容易。从您的向量开始：

DF2 <- data.frame(
  x = c(c(A1, A2, A3), c(B1, B2, B3)),
  y = rep(c("A", "B"), each = 15),
  z = rep(rep(1:3, each=5), 2),
  stringsAsFactors = FALSE
)
str(DF2)
# 'data.frame': 30 obs. of  3 variables:
#  $ x: num  1 2 9 6 4 5 1 9 2 3 ...
#  $ y: chr  "A" "A" "A" "A" ...
#  $ z: int  1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 ...

cols <- rainbow(3, s = 0.5)
boxplot(x ~ z + y, data = DF2,
        at = c(1:3, 5:7), col = cols,
        names = c("", "A", "", "", "B", ""), xaxs = FALSE)
legend("topleft", fill = cols, legend = c(1,2,3), horiz = T)

使用at手动控制位置，因此"视觉分组"不是非常稳健。（您可以使用width和/或boxwex控制它们之间的间距。）

你也可以选择 ggplot2：

library(ggplot2)
ggplot(DF2, aes(y, x, fill=factor(z))) +
  geom_boxplot()

- r2evans

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在第一次尝试绘制箱线图时，您如何使坐标轴加粗？ - Perro

这并不是加粗的，至少我没有明确地做任何操作。可能是与 ggplot2 不同的默认字体族或其他原因导致的。 - r2evans

Answer 2

您应该使用ggplot2

。

ggplot() + 
  geom_boxplot(data = df, mapping = aes(col_name, value, fill=index))  + 
  theme( axis.text.x = element_blank()) +
  geom_segment(data=hline1, mapping=aes(x=1, y=-0.5, xend=3, yend=-0.5), size=2) +
  annotate("text", x = 2, y = -1, label = "A") + 
  geom_segment(data=hline1, mapping=aes(x=4, y=-0.5, xend=6, yend=-0.5), size=2) +
  annotate("text", x = 5, y = -1, label = "B")

- Kush Patel

Answer 3

使用基本的R语言，我认为@r2evans的解决方案是最好的。然而，对于问题中代码的一个更简单的修复方法是使用选项xaxt="n":

boxplot(DF, col = rainbow(3, s = 0.5), at = c(1:3,5:7), xaxt = "n")
axis(side = 1, at = c(2,6), labels = c("A","B"))
legend("topleft", fill = rainbow(3, s = 0.5), legend = c(1,2,3), horiz = T)

这增加了在格式化轴时的灵活性。

- AAL