在R语言中，是否有一个包能够将network()或igraph()网络转换为与Rgraphviz兼容的网络？

Question

花了很多时间将网络格式化为SNA和igraph包中用于分析的格式。是否存在与Rgraphviz所需数据类型之间的桥梁？我的意思是，保留源到目的地、标签、边权重以及其他属性，如颜色等。

- Mittenchops

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你好。igraph和Rgraphviz哪个更好？ - skan

我更喜欢igraph，但这取决于你想做什么。 - Mittenchops

Answer 1

是的，非常容易，在igraph文档中有清晰的说明：

write.graph(mygraph, file="filename", format="dot")

- Mittenchops

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有没有不需要编写文件的解决方案？ - landau

Answer 2

我没有找到任何可以将igraph转换为Rgraphviz的包，但是有一种方法可以避免保存文件。函数graph::graphAM接收一个邻接矩阵，该矩阵可以使用函数igraph::get.adjacency从igraph中获取。

采用这种方法时，如果您有与节点或边缘相关联的任何功能，则需要逐个添加它们。

library(tidyverse)

# Create the Data
actors <- data.frame(name=c("Alice", "Bob", "Cecil", "David",
                        "Esmeralda"),
                 age=c(48,33,45,34,21),
                 gender=c("F","M","F","M","F"))
relations <- data.frame(from=c("Bob", "Cecil", "Cecil", "David",
                           "David", "Esmeralda"),
                    to=c("Alice", "Bob", "Alice", "Alice", "Bob", "Alice"),
                    same.dept=c(FALSE,FALSE,TRUE,FALSE,FALSE,TRUE),
                    friendship=c(4,5,5,2,1,1), advice=c(4,5,5,4,2,3))

# Create the igraph object
g <- igraph::graph.data.frame(relations, directed=TRUE, vertices=actors)

# transform igraph object in graph which will be used in Rgraphviz
graph::graphAM(igraph::get.adjacency(g) %>% as.matrix(),
           edgemode = 'directed') %>%
  Rgraphviz::layoutGraph() %>%
  Rgraphviz::renderGraph()

- fmassica