当mice返回“系统计算上奇异”的错误时，在R中进行插补。

Question

我想对一个中等大小数据框（约10万行）进行插补，其中30列中有5列具有缺失值（大约60％的比例）。

我尝试使用以下代码进行mice：

library(mice)    
data_3 = complete(mice(data_2))

第一次迭代后，我遇到了以下异常：

iter imp variable
  1   1  Existing_EMI  Loan_Amount  Loan_Period

Error in solve.default(xtx + diag(pen)): system is computationally singular: reciprocal condition number = 1.08007e-16

有其他更适合这种情况的包吗？我该如何解决这个问题？

- user8270077

Answer 1

你的5列可能存在多个不平衡的因素。当这些被转换为虚拟变量时，很有可能会有一列是另一列的线性组合。 mice 的默认插补方法涉及线性回归，这会导致一个无法反转的 X 矩阵，并最终导致错误。

将使用的方法更改为其他方法，如cart -- mice(data_2, method = "cart") --。同时，在填充过程中，请检查你调用的种子以获得可重复的结果。

我的建议是浏览mice的7个vignettes。你可以找到如何更改单独列而不是针对整个数据集使用的插补方法。

- phiver