如何在RMarkdown中显示代码但隐藏输出？

Question

我希望我的 HTML 文件展示这段代码，但不显示输出结果：

```{r echo=True, include=FALSE}
fun <- function(b)
    {
    for(a in b)
        {print(a)
        return(a * a)}
    }
y <- fun(b)
```

当我运行代码时，我需要打印出来以查看进度（实际上它是一个相当长的函数）。

但是在knitr文件中，我在另一个块中使用输出，所以我不想在这个块中看到它（并且没有进度的概念，因为代码已经运行）。

这里使用的echo=True, include=FALSE无法工作：整个东西都被隐藏了（这是include=FALSE的正常行为）。 有哪些参数可以用于隐藏打印，但显示我的代码？

- Laurent

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尝试使用 {r echo=T, results='hide'}。 - J_F

很好，这正是我在寻找的！我以前从未见过那个“results”参数。 - Laurent

但是怎么才能隐藏所有的输出呢？使用results='hide'仍然会显示警告信息，例如在使用library(package)时掩盖对象时。是否有选项可以隐藏打印到控制台的所有内容？ - stragu

你可以在library命令中使用warn.conflicts=F, quietly=T来做到这一点，例如library(package, warn.conflicts=F, quietly=T)。该命令的作用是禁止冲突警告，并使安装过程保持安静。 - Laurent

我不知道为什么，但这对我不起作用。 - T.Omalley

Answer 1

如 @J_F 在评论中所回答的那样，使用 {r echo = T, results='hide'}。

我想进一步扩展他们的回答 - 有很多资源可供您访问，以确定您的块和输出显示的所有可能选项 - 我在桌子上放了一份打印副本！

您可以在 RStudio 网站上找到它们，在CheatSheets下查找 R Markdown CheatSheet 和 R Markdown Reference Guide，或者在 RStudio 中导航到 "Help" 选项卡，选择 "CheatSheets"，并在那里查找相同的文档。

最后，如果您希望大多数块具有相同的行为，则可以运行以下代码（在第一个块中）来设置默认块选项：

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = T,
                      results = "hide")
```

稍后，您可以像这样修改单个块的行为，这将替换结果选项的默认值。请注意，保留了HTML标签。

```{r analysis, results="markup"}
# code here
```

- Nova

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非常好。我发现在编写伪代码或创建带有可测试代码的笔记本时非常有用，但可以排除输出，以便保持简洁和整洁！谢谢。 - Meisam H

@LachlanMacnish 现在我每周有三天的办公桌？哈哈 - undefined

Answer 2

results = 'hide'选项不能防止其他消息的打印。要隐藏它们，以下选项很有用：

• {r, error=FALSE}
• {r, warning=FALSE}
• {r, message=FALSE}

在每种情况下，相应的警告、错误或消息将被打印到控制台。

- jmon12

Answer 3

```{r eval=FALSE}

该文档默认显示代码，但会阻止代码块被执行，因此也不会显示任何结果。

- DryLabRebel

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对我来说，我想展示代码而不是图表，所以我使用了 echo=TRUE, eval=FALSE。 - GISHuman

对我来说，result="hide" 只显示了代码的最后一行，而 eval=F 则显示了整个代码。 - Salix

如果您不需要将此块的结果用于下一个块中，则仅使用“eval=F”即可。 - igorkf

我同意@igorkf的观点，如果该代码块用于下一个代码块，则eval=F不适用。应改用echo=T, results='hide'。 - Zawir Amin

@igorkf - 是的，我也同意。eval=F不会运行代码块。因此，任何结果在脚本的其余部分中都不可用。这些选项都有用例。 - DryLabRebel

Answer 4

对于静默载入库"library("name_of_library")"的代码，主要是展示代码，使用"{r loadlib, echo=T, results='hide', message=F, warning=F}"非常好。在我看来，这比"library(package, warn.conflicts=F, quietly=T)"更好。

- alika

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library(package, warn.conflicts=F, quietly=T)在控制台中抑制消息，但当Knitr编织到HTML时，在HTML输出中不抑制消息。 - randy

Answer 5

如果要完全静音输出，这是对我有效的方法：

```{r error=FALSE, warning=FALSE, message=FALSE}
invisible({capture.output({


# Your code here
2 * 2
# etc etc


})})
```

以上使用的5种措施包括：

1. error = FALSE （错误为假）
2. warning = FALSE （警告为假）
3. message = FALSE （消息为假）
4. invisible() （不可见函数）
5. capture.output() （捕获输出）

- stevec

Answer 6

为了隐藏警告信息，您也可以执行以下操作： {r, warning=FALSE}

- Natalia M Perkins