防止knitr/Rmarkdown将代码与输出混合显示

Question

当我使用knitr将以下代码构建为HTML文档：

Chunk Output
========================================================

Outside a chunk.

```{r chunk1, results='asis'}

cat('Inside a chunk\n\n')

for (i in 1:3) {
    cat('* Inside loop #', i, '\n')
}

cat('Outside a loop, but still inside the first chunk')
```

Between chunks.

```{r chunk2, results='asis'}

cat('Inside second chunk')

```

我得到输出结果，其中的chunk1代码与cat语句的输出交错显示。有趣的是，在for循环内的输出会作为单个块输出。

我希望所有来自chunk1的代码都先出现，然后是所有chunk1的输出。是否有一种方法可以要求Rmarkdown/knitr避免目前正在进行的更细粒度的交错呈现？

- Harlan

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@Harlan 我认为这并不容易，因为knitr处理这些块的方式。一个最小的hack是将块放在{}中。 - hadley

@Hadley，那个方法可行，但显然不是最理想的。如果你把它写成答案，我会称之为解决方案。 :) - Harlan

这里有另一种解决方案，您可以使用results = 'hide'来抑制输出，并添加一个依赖块，其中echo = F, results = "asis"。您可以提交一个功能请求，要求添加一个名为results = "hold"的选项，就像fig.show = "hold"一样，它会自动为结果执行此操作，因为似乎有一些用例需要这样做。 - Ramnath

收到功能请求，代码已完成。 - Yihui Xie

这是客户服务的最佳体现，@Yihui！ - Ramnath

Answer 1

这是我提出的解决方案

Chunk Output
========================================================

Outside a chunk.

```{r chunk1, results='hide'}

cat('Inside a chunk\n\n')

for (i in 1:3) {
    cat('* Inside loop #', i, '\n')
}

cat('Outside a loop, but still inside the first chunk')
```

```{r ref.label = 'chunk1', results = 'asis', echo = F}

```

在最新版本的knitr中，@yihui添加了一个新的代码块选项results = "hold"，自动将所有输出保留到最后。因此，我们只需编写

Chunk Output
========================================================

Outside a chunk.

```{r chunk1, results='hold'}

cat('Inside a chunk\n\n')

for (i in 1:3) {
    cat('* Inside loop #', i, '\n')
}

cat('Outside a loop, but still inside the first chunk')
```

- Ramnath