在Rmarkdown/knit中隐藏R代码，仅显示结果

Question

在我的R Markdown文档中，有时候我希望只生成报告而不显示实际的代码（特别是当我将其发送给老板时）。我该如何隐藏R代码，仅显示图表和结果?

例如:

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output: html_document
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```{r fig.width=16, fig.height=6}
plot(cars)
```

这显示了命令和图表。我该如何从我的HTML报告中删除命令？

- Mark

Answer 1

当然，只需要去做。

```{r someVar, echo=FALSE}
someVariable
```

展示一些（之前计算的）变量someVariable。或者运行打印等等的代码。

所以对于绘图，我有例如：

### Impact of choice of ....
```{r somePlot, echo=FALSE}
plotResults(Res, Grid, "some text", "some more text")
```

其中绘图函数plotResults来自本地包。

- Dirk Eddelbuettel

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将英语翻译成中文。 仅返回已翻译的文本：或者在文档头部放置 opts_chunk $ set（echo = FALSE） 以全局设置。 - Ben Bolker

确保不要重复使用 opts_chunk 命令！在文档顶部（代码块中）放置 {r echo=FALSE} opts_chunk$set(echo=FALSE) 应该可以解决问题。 - Serenthia

Answer 2

你可能也会感兴趣知道，你可以使用：

{r echo=FALSE, results='hide',message=FALSE}
a<-as.numeric(rnorm(100))
hist(a, breaks=24)

排除所有你输入的命令，它输出的结果以及 R 输出的所有信息（例如，在 library(ggplot) 或其他情况下）。

- Geoffrey Stoel

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很好，results='hide' 抑制了文本输出，但显示图形！ - kjetil b halvorsen

Answer 3

这里只是整合答案并对基础知识进行扩展，以下有三个选项：

1）隐藏代码（单个代码块）

我们可以在代码块的标题中添加echo=FALSE：

```{r echo=FALSE}
plot(cars)
```

2）隐藏代码块（全局）。

我们可以使用knitr::opts_chunk$set函数更改knitr的默认行为。 我们在文档开头调用它，并在块标题中包含include = FALSE以抑制任何输出：

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output: html_document
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```{r include = FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo=FALSE)
```

```{r}
plot(cars)
```

3) 折叠代码块

对于 HTML 输出，我们可以使用代码折叠功能隐藏输出文件中的代码。虽然仍将包括代码，但只有当用户单击时才能看到它。您可以在这里进一步阅读有关此功能的信息。

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output:
  html_document:
    code_folding: "hide"
---


```{r}
plot(cars)
```

- Michael Harper

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我可以在导言中使用选项来排除打印代码，以便将其编织为PDF吗？knitr::opts_chunk$set(echo=FALSE)可以实现，但我更喜欢像pdf_document code_folding: "hide"这样的选项。 - Flo

Answer 4

或者，您也可以通过 markdownreports包 在运行时解析一个标准的Markdown文档（不含代码块本身）。

- bud.dugong