igraph：在布局算法中指定权重

Question

我发现了多篇文章（例如这里和这里），阐述了如何通过添加边权重来修改布局。

但是当我执行

require(igraph)

g <- graph.ring(10)

plot(g)

set.seed(28100)
E(g)$weight <- sample(1:10, 10, replace = TRUE)
E(g)$weight 
# [1] 4 3 4 6 2 9 5 2 9 7
l <- layout_with_fr(g, weights=E(g)$weight)

plot(g, layout=l)

使用R版本3.2.2和igraph版本1.0.1，我得到了完全相同的布局。相反，我希望获得一种布局，其中较高（低）权重的边更短（长）。换句话说，通过高权重边连接的节点比通过低权重边连接的节点更接近彼此。

我做错了什么吗？

- CptNemo

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当我运行代码时，布局会稍微改变。您想要什么样的行为/布局？请详细说明。R版本3.2.0，图形版本1.0.1 - harre

Answer 1

新的Fruchterman-Reingold布局实现（从igraph 1.0.0开始）存在/曾经存在一个错误，导致它忽略权重。这个问题已经在开发版本中得到修复，但似乎该版本尚未发布。您可以使用devtools包从Github安装开发版本：

devtools::install_github("gaborcsardi/pkgconfig")
devtools::install_github("igraph/rigraph")

- Tamás

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确实，这是一个bug。 - CptNemo