R Circlize 弦图输出

Question

我刚接触R语言中的circlize包。但是，我的第一个弦图输出看起来更像椭圆形而不是文档示例中的圆形。我该怎么办？下面是代码和图片。

    #random matrix, for illustration
    mat
       E1 E2 E3 E4 E5 E6
    S1  8 13 18  6 11 14
    S2 10 12  1  3  5  7
    S3  2 16  4 17  9 15
    chordDiagram(mat)

这是我的输出结果：

这是我想要的结果：

- Juan Mier

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还有其他的和弦图选项。 - SymbolixAU

Answer 1

您需要使用 par(pty="s") 强制一个正方形绘图区域：

library(circlize)

mat <- read.table(text=
",E1,E2,E3,E4,E5,E6
S1,8,13,18,6,11,14
S2,10,12,1,3,5,7
S3,2,16,4,17,9,15",header=TRUE,sep=",",row.names=1)
par(pty="s")
chordDiagram(as.matrix(mat))

- digEmAll