如何使用H5PY将HDF5文件导出为NumPy格式？

Question

我有一个包含三个数组的现有hdf5文件，我想使用h5py提取其中一个数组。

- l.z.lz

Answer 1

h5py已经将文件读入为numpy数组，因此只需：

with h5py.File('the_filename', 'r') as f:
    my_array = f['array_name'][()]

[()] 的意思是读取整个数组；如果不这样做，它就不会读取整个数据，而是为您提供对子部分的延迟访问（当数组非常大但您只需要其中一小部分时非常有用）。

- Danica

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非常感谢你，Dougal。我已经修改了代码如下：

f = h5py.File('D:/!JODI/Macau Wind/u_100m/20100101.hdf5', 'r') my_array = f['u'].value f.close()

另一个愚蠢的问题是输出数组在哪个文件中？我在哪里可以找到输出数组？非常感谢。 - l.z.lz

我不确定你所说的输出数组 my_array 是什么意思？除非你自己保存（使用 h5py.File 或类似 numpy.save 的方法），否则对其进行的任何更改都只会存储在内存中。 - Danica

为了后代：.value 方法已经不再可用。请使用 f['array_name'][()]代替。 - Danica

Answer 2

对于这个问题来说，使用SpacePy包可能有些过头了，但如果你有很多类似的事情要做，它可以让一些操作变得更加容易。

datamodel.fromHDF5()文档。它返回一个类似于h5py处理数据的数组字典。

- Brian Larsen