如何将NumPy链接到使用MKL作为后端？

Question

我安装了numpy，但它没有可用的BLAS后端：

(pyrepoux) bash-4.2$ python
Python 3.7.3 | packaged by conda-forge | (default, Dec  6 2019, 08:54:18) 
[GCC 7.3.0] :: Anaconda, Inc. on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy as np
>>> np.show_config()
blas_mkl_info:
  NOT AVAILABLE
blis_info:
  NOT AVAILABLE
openblas_info:
    libraries = ['openblas', 'openblas']
    library_dirs = ['/usr/local/lib']
    language = c
    define_macros = [('HAVE_CBLAS', None)]
blas_opt_info:
    libraries = ['openblas', 'openblas']
    library_dirs = ['/usr/local/lib']
    language = c
    define_macros = [('HAVE_CBLAS', None)]
lapack_mkl_info:
  NOT AVAILABLE
openblas_lapack_info:
    libraries = ['openblas', 'openblas']
    library_dirs = ['/usr/local/lib']
    language = c
    define_macros = [('HAVE_CBLAS', None)]
lapack_opt_info:
    libraries = ['openblas', 'openblas']
    library_dirs = ['/usr/local/lib']
    language = c
    define_macros = [('HAVE_CBLAS', None)]

我可以执行pip install mkl，但输出结果与上述相同。如何将numpy链接到使用MKL作为BLAS / LAPACK后端？

- SkyWalker

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使用经过优化的Intel版本的Python可能会有所帮助（尤其是经过优化的Intel Anaconda）。请参阅此处。请注意，多个BLAS库之间可能会发生冲突。只安装/使用一个BLAS库通常可以避免一些麻烦。或者，您可以尝试调整LD_LIBRARY_PATH和LD_PRELOAD参数。 - Jérôme Richard

https://pypi.org/project/intel-numpy/ - user13963867

Answer 1

你可以尝试使用英特尔Python。创建一个带有英特尔Python和所需包（如英特尔MKL、英特尔NumPy等）的环境。

conda create -n <env-name> intelpython3_full python=3.7.3
conda activate <env_name>
pip install mkl
pip install intel-numpy

请尝试导入numpy并运行np.show_config()。

参考：https://pypi.org/project/mkl/ https://pypi.org/project/intel-numpy/ 更好的方法是安装Intel基础工具包并获取变量源代码。 该工具包附带Intel mkl和intel python。 您只需要获取环境变量即可。

source <basekit-installation-directory>/setvars.sh

安装指南：https://software.intel.com/content/www/us/en/develop/documentation/installation-guide-for-intel-oneapi-toolkits-linux/top.html

您还可以尝试Jerome Richard提供的建议-尝试将LD_LIBRARY_PATH和LD_PRELOAD路径设置为mkl库的.so文件。 参考资料：https://software.intel.com/content/www/us/en/develop/articles/optimizing-without-breaking-a-sweat.html

- Raeesa - Intel

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非常感谢您的回复，但很遗憾目前还没有适用于Python 3.7.3的Intel-Numpy版本。否则的话，这确实会变得非常简单。 - SkyWalker

你可以创建环境 $ conda create -n idp python=3.7.3 -c intel，并安装 Intel NumPy。如果 3.7.9 版本也可以的话，���么安装 intelpython_full 会更好。 - Raeesa - Intel