如何在Anaconda中将MKL链接到已安装的Numpy？

Question

>>> numpy.__config__.show()
atlas_threads_info:
  NOT AVAILABLE
blas_opt_info:
    libraries = ['f77blas', 'cblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/home/admin/anaconda/lib']
    define_macros = [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.4\\""')]
    language = c
atlas_blas_threads_info:
  NOT AVAILABLE
openblas_info:
  NOT AVAILABLE
lapack_opt_info:
    libraries = ['lapack', 'f77blas', 'cblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/home/admin/anaconda/lib']
    define_macros = [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.4\\""')]
    language = f77
openblas_lapack_info:
  NOT AVAILABLE
atlas_info:
    libraries = ['lapack', 'f77blas', 'cblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/home/admin/anaconda/lib']
    define_macros = [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.4\\""')]
    language = f77
lapack_mkl_info:
  NOT AVAILABLE
blas_mkl_info:
  NOT AVAILABLE
atlas_blas_info:
    libraries = ['f77blas', 'cblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/home/admin/anaconda/lib']
    define_macros = [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.4\\""')]
    language = c
mkl_info:
  NOT AVAILABLE

这是numpy。config.show()

而这个numpy基于Anaconda。

在/home/admin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/numpy中。

同时，我也在/opt/intel/mkl中安装了MKL。

此外，当我在这个Anaconda和这个numpy中使用Theano时，似乎我可以使用MKL。

谢谢~

- Issac

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你是否在一所认可的大学就读？如果是，请在此处注册学术许可证（https://store.continuum.io/cshop/academicanaconda），然后执行“conda install accelerate”命令。 - jme

是的，连接到不同的BLAS/LAPACK的唯一方法是重新编译或获取不同的二进制文件。Anaconda学术许可证可以让您获得更快的二进制文件。从源代码编译numpy也并不是非常困难。 - IanH

@jme 谢谢你的回答。是的，我是一名学生。但是看起来，当我使用这个Anaconda和这个numpy时，我可以使用MKL。Theano不是基于Numpy吗？ - Issac

您IP地址为143.198.54.68，由于运营成本限制，当前对于免费用户的使用频率限制为每个IP每72小时10次对话，如需解除限制，请点击左下角设置图标按钮（手机用户先点击左上角菜单按钮）。 - Issac

Answer 1

要做到这一点，您需要获取Numpy源代码并在主文件夹中创建一个site.cfg文件，告诉Numpy在哪里查找MKL库。使用site.cfg.example文件作为指南；其中有一个关于MKL的部分，应该告诉您需要的确切行。

一旦您拥有了site.cfg文件，请运行python setup.py config。这将输出配置信息（看起来像numpy.config.show()的输出）。您应该在其中看到MKL库的路径（如果没有，请尝试调整site.cfg文件）。

然后，您可以使用python setup.py build和python setup.py install进行构建和安装。您可能需要先卸载旧的Numpy。

我在博客上写了一篇关于使用OpenBLAS安装Numpy的文章。虽然你的情况可能有所不同，但我认为很多步骤是相似的。

- hunse