如何将Nifti文件转换为Numpy数组？

Question

我有一个保存在Nifti文件(.ii.gz)中的3D数组，我想将其保存为一个3D numpy数组。我使用Nibabel将Numpy转换为Nifti1格式，那么我能否做相反的操作呢？

- Char

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我已更新我的帖子。 - piRSquared

Answer 1

来自 nipy

import numpy as np
import nibabel as nib

img = nib.load(example_filename)

a = np.array(img.dataobj)

- piRSquared

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如何将img转换为numpy数组？np.array(img)？ - Char

如何将numpy数组转换回.nii格式？ - Soyol

@Soyol，你可以发布一个关于这个问题的新问题。有一种方法可以做到这一点。 - seralouk

Answer 2

你也可以这样做：

import numpy as np
import nibabel as nib

img_nifti = nib.load(filepath)
img = img_nifti.get_data()

- schrodingercat

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get_data() 已被弃用，现在你可以使用 get_fdata() 来代替。 - Aelius