使用mlab在mayavi中为许多点添加文本注释

Question

我正在尝试使用mayavi.mlab中的points3d()函数注释绘制的点。每个点都与一个标签相关联，我想使用text3d()函数在点旁边绘制标签。绘制点很快，但是mlab.text3d()函数似乎不接受坐标数组，所以我必须循环遍历点并单独绘制文本，这非常缓慢：

        for i in xrange(0, self.n_labels):
            self.mlab_data.append(
                mlab.points3d( pX[self.labels == self.u_labels[i], 0],
                               pX[self.labels == self.u_labels[i], 1],
                               pX[self.labels == self.u_labels[i], 2],
                               color=self.colours[i],
                               opacity=1,
                               scale_mode="none",
                               scale_factor=sf ) )

            idcs, = np.where(self.labels == self.u_labels[i])
            for n in idcs.flatten():
                mlab.text3d( pX[n, 0],
                             pX[n, 1],
                             pX[n, 2],
                             "%d" % self.u_labels[i],
                             color=self.colours[i],
                             opacity=1,
                             scale=sf )

有什么想法可以加速这个过程吗？另外，是否可以添加一个图例（例如在matplotlib中），我在文档中找不到任何信息。

谢谢， Patrick

- user588241

Answer 1

您上面的做法会在每次绘制点或文本时呈现场景。这很慢。您可以禁用场景呈现，进行绘图，然后通过figure.scene.disable_render = True/False呈现场景：

    import scipy
    from mayavi import mlab

    X = 100 * scipy.rand(100, 3)
    figure = mlab.figure('myfig')
    figure.scene.disable_render = True # Super duper trick
    mlab.points3d(X[:,0], X[:,1], X[:,2], scale_factor=0.4)
    for i, x in enumerate(X):
        mlab.text3d(x[0], x[1], x[2], str(i), scale=(2, 2, 2))
    figure.scene.disable_render = False # Super duper trick

我在 morphic Viewer 类中使用了这个技巧和其他技巧。另一个好的技巧是重复使用现有对象，即如果您已经绘制了文本，请不要重新绘制它们，只需更新它们的位置和文本属性。这意味着保存 mlab 对象。您可以在 morphic.Viewer 中看到我如何做到这一点。 https://github.com/duanemalcolm/morphic/blob/master/morphic/viewer.py

- duane