能否在pypy下安装scipy？

Question

我使用pypy创建了一个虚拟环境并尝试安装scipy，但是安装失败并提示以下错误信息：

distutils.errors.DistutilsError: 设置脚本退出时出现错误：命令“cc -O2 -fPIC -Wimplicit -O2 -fPIC -Wimplicit -O2 -fPIC -Wimplicit -DHAVE_NPY_CONFIG_H=1 -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE=1 -D_LARGEFILE64_SOURCE=1 -DNO_ATLAS_INFO=1 -DHAVE_CBLAS -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -Inumpy/core/include -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/include/numpy -Inumpy/core/src/private -Inumpy/core/src -Inumpy/core -Inumpy/core/src/npymath -Inumpy/core/src/multiarray -Inumpy/core/src/umath -Inumpy/core/src/npysort -I/home/luke/Programowanie/Python/connect4/venv-pypy/include -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/private -c numpy/core/src/multiarray/scalarapi.c -o build/temp.linux-x86_64-3.2/numpy/core/src/multiarray/scalarapi.o” 失败，退出状态为 1

有一个特定的适用于pypy的numpy版本，但我只找到了一个关于scipy的旧捐款号召。自那时以来有什么变化吗？

- Luke

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scipy 有编译代码，就像 numpy 一样。所以即使你有一个在 PyPy 上工作的 numpy（它是否完全兼容？），这也不意味着你可以在其上安装常规的 scipy。如果你没有找到 PyPy 的 scipy，那么你就不能添加它。但要记住，scipy 是一组松散连接的软件包。 - hpaulj

那个募捐呼吁是为了 numpy 提案。该提案明确排除了 scipy。换句话说，没有人正式在开发 scipy 版本。 - hpaulj

@hpaulj 他们在文本后面提到了scipy：“具体来说，我们不打算（...）实现其他科学库，如SciPy、matplotlib或biopython”。 - Luke

Answer 1

是的，从Scipy 1.1.0开始是可能的。然而需要新版本的PyPy（>= 6.0.0）和Numpy，numpy>= 1.14.3，最好在发布时使用numpy>=1.15.0。安装可以通过通常的方式完成。

pypy3 -mpip install numpy
pypy3 -mpip install scipy

假设您已经安装了BLAS/LAPACK，那么首先您应该确保能够从源代码安装numpy/scipy到正常的Python。可能没有人尝试在Windows上使用Pypy进行操作，所以您需要自己解决。这也可能不适用于NumPyPy - 您需要原始的Numpy。其他答案说“不行”，因为这是2018年5月之前的情况。

- pv.

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从今天开始，您还必须安装pybind11；然而，仍然会出现pybind错误导致程序中断：/usr/local/include/detail/common.h:134:19: 致命错误: cstddef: 没有那个文件或目录。 - weberc2

对于scipy，我不得不安装一些依赖项，如sudo apt install gfortran libatlas-base-dev libopenblas-dev pypy3-dev，但是它仍然无法构建。 - Amin Ya

Answer 2

不行。SciPy有一些与cpython的C API交互的部分，而pypy不支持这样做。

编辑：截至2018年5月，这是不正确的，scipy与pypy兼容。有关详细信息，请参见@pv的答案。

- ev-br

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自scipy 1.1.0版本以后就不再是这样了。请参见pv的评论。 - cphyc

现在，我认为这个答案应该被删除。也许你可以添加一个pypy版本，看看它是否可行？ - Martin Thoma

Answer 3

看起来@piv.s的好答案中的链接不再包含所需内容。 要安装BLAS/LAPACK并避免在Ubuntu上出现NotFoundError: no lapack/blas resources found等安装错误，首先运行：

sudo apt-get install libatlas-base-dev

然后使用与你的pypy相对应的pip（而不是系统的pip）:

pip install numpy
pip install scipy

或者像piv提到的那样，也可以达到效果。

- Farzad Vertigo

Answer 4

截至目前，numpy和scipy可以通过pip在PyPy上安装，但有一个问题：如果您将其在虚拟环境中运行（您可能应该这样做），请记得使用“--always-copy”创建虚拟环境，否则virtualenv将为“include”目录创建符号链接，使其对用户只读，这将破坏pybind11的安装（它是scipy的依赖项）。

- user2348697

Answer 5

不，但是奇迹般的是，matplotlib 可以在 pypy 中使用，在 jupyter notebook 和作为一个独立版本（通过 wx widgets）都可以工作。所以这并不是完全不可能的。

- Antony Hatchkins