我有一大段代码,目前速度瓶颈在于聚合步骤。 我希望加快数据分组步骤的速度。我的代码中,一个简单而非平凡的示例(SNOTE)的数据如下: library(data.table) a = sample(1:10000000, 50000000, replace = TRUE) b = sam...
我正在使用R语言中的parallel包中的mclapply()并行运行模拟程序,希望能够跟踪每个函数调用的进度。因此,我决定改用pbmcapply包中的pbmclapply(),以便每次运行模拟时都有一个进度条(pbmclapply()是为mclapply()特别创建的包装器,因此它们应该具有...
当我使用mclapply时,偶尔(真的很随机)会出现错误的结果。这个问题在互联网上的其他帖子中被很彻底地描述了,例如(http://r.789695.n4.nabble.com/Bug-in-mclapply-td4652743.html)。然而,还没有提供解决方案。有谁知道如何解决这个问题吗...
我将使用doSNOW包,尤其是parLapply函数,对一组大型栅格数据集(OS:Windows x64)进行重新分类(以及其他操作)。 代码看起来有些像这个最小化的例子: library(raster) library(doSNOW) #create list containing t...
我对所有 "embarrassingly parallel" 的计算使用 mclapply。我发现它干净易用,当参数mc.cores = 1和mc.preschedule = TRUE时,我可以在mclapply内的函数中插入browser(),就像在普通的 R 中一样逐行调试。这有助于更快地...
使用mclapply()时,所有发出的警告似乎都被抑制了:library(multicore) mclapply(1:3, function(x) warning(x)) [[1]] [1] "1" [[2]] [1] "2" [[3]] [1] "3" 使用 lapply 时将会得到:...
我最近开始在一个项目中使用R语言的并行技术,并且已经通过parallel包中的mclapply函数使程序在Linux系统上运行。然而,我对于Windows系统上的parLapply函数理解不够深入,遇到了一些问题。 通过使用mclapply函数,我可以设置核心数和迭代次数,并将它们传递给我的...
我很喜欢 plyr 的 llply 中的设置 .progress = 'text'。但是,当使用来自multicore包的 mclapply 时,它会引起我的焦虑,因为列表项被发送到各个核心然后在最后汇总。 我一直在输出像 *当前正在进行 sim_id #....* 这样的消息,但这并不太有...