pydot.InvocationException: GraphViz的可执行文件未找到。

Question

我试图运行这个决策树学习的示例，但是出现了以下错误信息:

File "coco.py", line 18, in graph.write_pdf("iris.pdf") File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pydot.py", line 1602, in lambda path, f=frmt, prog=self.prog : self.write(path, format=f, prog=prog)) File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pydot.py", line 1696, in write dot_fd.write(self.create(prog, format)) File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pydot.py", line 1727, in create 'GraphViz\'s executables not found' ) pydot.InvocationException: GraphViz's executables not found

我看到了这篇文章关于类似错误的解释，但是即使我按照他们的解决方法（先卸载graphviz和pydot，然后再相反的顺序重新安装），问题仍然存在... 我正在使用MacOS (Yosemite)。

有任何想法吗？感谢帮助。

- Chewbacca

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请在您的问题中添加如何安装graphviz的信息（例如homebrew，macports等）。似乎您的PATH变量存在问题。 - cel

Graphviz 并不是一个 Python 工具。在pypi上的 Python 包为在 Python 代码中使用 Graphviz 提供了一种方便的方式。但你仍需要安装 Graphviz 可执行文件，这些文件并不是 Pythonic 的，因此不会与这些包一起发布。你可以使用通用的包管理程序（例如 homebrew）来安装它们。 - cel

@cel，你的评论很有价值，完全回答了问题。也许你应该把它们变成一个答案？ - Akavall

@Akavall，我并不是很想在这里写一个答案。如果你认为回答这个问题是个好主意，可以把我的评论当作你的答案模板。 - cel

在 Mac OS X 上，我建议从源代码开始进行全新的 Macports 安装，然后安装 GraphViz，sudo port install graphviz。 - Claude COULOMBE

Answer 1

cel在评论中回答：

Graphviz不是Python工具。在PyPI上提供的Python包为在Python代码中使用Graphviz提供了方便的方法。但是，您仍然需要安装Graphviz可执行文件，这些文件并非Pythonic，因此不随这些软件包一起提供。你可以通过通用的软件包管理器（例如homebrew）来安装那些文件。

就我个人而言，在Ubuntu 14.04上，我所做的只是：

sudo apt-get install graphviz

- Akavall

Answer 2

brew install graphviz
pip install -U pydotplus

...在我的MacOSX上运行良好。

- Mark

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这个解决方案在我的MacOS Mojave 10.14.5版本上有效。 - Papa Delta

这对我有用，Mac Monterey 12.2.1，在多次conda和pip安装迭代之后。对我来说，诀窍是通过brew。 - Magnetar

Answer 3

在Windows 8上，这对我解决了同样的问题：

import os     
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

- Maksim Panfilov

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一个更加永久的解决方案是在适当的配置文件中设置环境的 PATH 变量（在 *nix 系统中通常是 ~/.bashrc）。 - 0 _

Answer 4

当我使用pip安装pydot和graphviz时，遇到了同样的问题，后来我在这里找到了答案。

具体来说，我首先卸载了我分别使用pip安装的pydot和graphviz（使用sudo pip uninstall pydot和相同的方式卸载graphviz）。然后，我运行了sudo apt-get install python-pydot，这解决了问题。

- djurikom

Answer 5

conda install -c anaconda graphviz        
conda install -c anaconda pydot

- scarain

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这在iOS上对我非常有效。谢谢，@scarain - Pramit

注意Mac用户，这是你的答案-谢谢，Scarain！ - Mr. Vanderstelt

不要这样做，Mac用户，你必须重新安装所有其他模块。 - Lakshay

Answer 6

对于Windows用户：
1.安装Graphviz
2.将Graphviz路径添加到PATH变量中
3.重新启动PyCharm或其他编译器。

自版本2.31起，Visual Studio软件包不再更改PATH变量或访问注册表。如果您希望使用命令行界面访问Graphviz，或者正在使用调用Graphviz程序的其他程序，您需要自己设置PATH变量。

- Matiji66

Answer 7

这对我在Ubuntu 18.04上同样有效：

$ sudo apt-get install graphviz  

- Kradcifer

Answer 8

如果你使用的是Mac操作系统，可能会遇到这个问题。我曾经尝试通过pip安装graphviz，但是没有成功。所以我又用brew重新安装了一次，这样就可以了。

请使用以下命令：

``` brew install graphviz ```

- Codified

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或者 arch -arm64 brew install graphviz - 谢谢 - rodmclaughlin

Answer 9

我遇到了类似的问题，解决方法是更改路径。

这是我所做的：

将电脑上的“graphiz”路径复制粘贴到控制面板中的环境变量>路径中。

例如： Graphiz路径：C:\Apps\Program Files\Continuum\Anaconda2\Library\bin\graphviz)

（我已经将其安装在Apps文件夹中。对于您来说，可能位于不同的路径中）

在环境变量中设置路径：

转到控制面板>控制面板>系统和安全>系统。单击高级设置，然后单击高级。您会在右下角找到环境变量。单击路径以编辑并保存它。关闭IDE并重新打开它。

对我有效。

- SEM

Answer 10

我遇到了同样的问题，我的问题通过以下方式得以解决：

1. 运行命令 sudo port install graphviz
2. 如果端口出现错误，则根据您使用的版本首先从下面的链接中安装端口https://guide.macports.org/chunked/installing.macports.html
3. 安装端口后运行命令 sudo port install graphviz

如果您正在使用iPython，请重新启动Python内核并再次运行。

- Milind Patil