安装Graphviz 2.38后出现“RuntimeError：请确保Graphviz可执行文件在您的系统路径上”的错误提示。

Question

我下载了 Graphviz 2.38 MSI 版本并安装在文件夹 C:\Python34 下，然后运行了 pip install Graphviz，一切顺利。在系统路径中我添加了 C:\Python34\bin。当我尝试运行一个测试脚本时，在代码行 filename=dot.render(filename='test')，我收到了一条消息。

 RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

我试图将"C:\Python34\bin\dot.exe"添加到系统路径中，但没有成功，我甚至创建了一个名为"GRAPHVIZ_DOT"的新环境变量，并将其值设置为"C:\Python34\bin\dot.exe"，但仍然无法正常工作。我尝试卸载Graphviz和pip uninstall graphviz，然后重新安装并再次使用pip安装，但仍然无效。

完整的回溯消息如下:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 220, in render
    proc = subprocess.Popen(cmd, startupinfo=STARTUPINFO)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Documents\Kissmetrics\curves and lines\eventNodes.py", line 56, in <module>
    filename=dot.render(filename='test')
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 225, in render
    'are on your systems\' path' % cmd)
RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

有人对此有经验吗？

- liga810

Answer 1

你应该在系统中安装graphviz软件包（不仅是Python软件包）。在Ubuntu上，你应该尝试：

sudo apt-get install graphviz

- kame

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如果这不起作用（它会说包已被引用但不存在之类的），请运行 sudo apt-get update 以更新 apt-get 并告诉它哪些包可用。 - Pro Q

如果你在 Docker 容器中（就像我一样），我已经在 root 下，只需要运行 apt-get install graphviz 即可。 - kevin_theinfinityfund

希望我能帮助到某个人。这对我来说第一次没有起作用，所以我运行了 sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade，之后它就可以工作了。 - dylanvanw

如果我只想在虚拟环境中安装graphviz怎么办？ - Vadim

Answer 2

这个应该解决MacOS上的问题。

brew install graphviz

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为了解释给新手使用Conda的误解。当我们运行conda install graphviz时，它会安装Graphviz的二进制文件（目前还不能在Python中执行）。

然后，我们通常还会安装conda install python-graphviz，这将安装用于在Python中运行Graphviz二进制文件的包装器，问题是我们可能会收到"graphviz"不可执行的错误消息。

因此，最好使用Homebrew来安装Graphviz二进制文件，然后再安装python-graphviz。Homebrew将确保二进制文件可执行。

- Rouzbeh

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对于 Mac，这似乎是最佳选择。除非您想使用 MacPorts 并从此处安装 graphviz：http://www.graphviz.org/Download_macos.php。 - Alex

谢谢，它在我的MAC上运行了。我尝试过使用pip和conda安装，但都没有成功。 - Chau Pham

我该如何找到我的bin文件夹，其中我有graphviz。我遇到了这个问题，现在真的很烦恼。刚刚检查了一下，我有graphviz 2.38。 - Herc01

在安装Graphviz之前，我必须运行：xcode-select --install - Va5ili5

它在 Monterey 12.3 上对我有效。 - Guillaume-ds

Answer 3

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

在Windows中，只需在开头添加以下2行代码，其中'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'需替换为您的bin文件所在地址。

这样就解决了问题。

- Aprameyo Roy

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在Windows系统中工作时，我从这里https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html下载了graphviz-2.38.zip。解压缩并将其放置在提到的文件夹中。 - user3046442

这对我很有效。我尝试将其添加到用户和系统环境变量中，但那并不起作用，只有你的解决方案对我有效。 - Tom

这对我也起作用了，但在运行之前它抛出了另一个错误。由于某种原因，它给了我一个并排配置....-错误。我还不得不重新安装Microsoft Visual C++ 2008可再发行软件包（x86）。如果有人遇到同样的问题，这是链接：[https://www.microsoft.com/de-DE/download/details.aspx?id=29] - Marco

我使用了Chocolatey来安装Graphviz choco install -y graphviz。 - reddi.eth

没错，这个可行。确保下载正确的Graphviz。我还将Graphviz二进制文件放在了用户和系统路径上。 - max

Answer 4

对于Windows：

1. 从https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html下载Graphviz软件包并安装。
2. 安装Python的graphviz软件包。
3. 将C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin添加到用户路径中。
4. 将C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe添加到系统路径中。

这对我有用！

- Jyotsna_b

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请关闭正在运行Jupyter Notebook的“cmd”窗口。因为已经打开的“cmd”无法获取新的环境变量更改。 - Rohit Nandi

直到我重新启动系统之后，它才起作用。 - Mohammad Nazari

这个完美地解决了问题。只需要重新启动笔记本电脑即可。谢谢。 - Amresh Giri

你不需要重新启动整个系统，而只需重新启动Python内核即可。 - SujaiSparks

@SujaiSparks - 没有起作用 - 我不得不重新启动整个系统。 - Alaa M.

Answer 5

尝试使用：

conda install python-graphviz

如果您使用pip install graphviz，则graphviz可执行文件位于与conda目录不同的路径上。

- Abishek

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Conda install graphviz 可以在 Windows 上正常工作！似乎没有其他方法可行 :\ - Joel Carneiro

pygraphviz在使用conda时有一个很大的警告，但不清楚为什么。 - Adam Burke

我在Anaconda提示符中运行了“conda install python-graphviz”，一旦执行完成，只需重新启动Jupyter笔记本内核即可。这对我有用。 - mpriya

我在Anaconda提示符中运行了"conda install python-graphviz"命令，执行完成后，只需重新启动Jupyter笔记本内核即可。这对我起作用了。同样在Windows上也可以运行。 - Mata

Answer 6

步骤1: 安装Graphviz二进制文件

Windows:

1. 从http://www.graphviz.org/download/下载Graphviz
2. 将以下内容添加到PATH环境变量中（请提及安装的Graphviz版本）:
   • C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin
   • C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe
3. 关闭任何打开的Juypter笔记本和命令提示符窗口
4. 重新启动Jupyter/cmd提示符并进行测试

Linux:

1. sudo apt-get update
2. sudo apt-get install graphviz
3. 或者从http://www.graphviz.org/download/手动构建

步骤2: 安装python的graphviz模块

pip:

• pip install graphviz

conda:

• conda install graphviz

- Chankey Pathak

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在Winzoz上已经为我解决了。 - rakwaht

非常好的解释！谢谢~ - Bright Chang

Answer 7

这显示了一些路径问题：

pip install graphviz

所以这对我有用:

sudo apt-get install graphviz

- VARAT BOHARA

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sudo apt-get install graphviz 不是 pip install 的替代方案。 - sajid

Answer 8

操作系统为OSX Sierra， Python版本为2.7，Graphviz版本为2.38。

使用pip install graphviz和conda install graphviz都可以解决问题。

pip仅会遇到与您相同的路径问题，conda则只会遇到导入错误。

- Leighton

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只有这个对我起作用了，在尝试了所有方法之后。谢谢。 - Meghna Natraj

Conda install graphviz 在 Windows 上运行了！其他的方法好像都不起作用 :\ - Joel Carneiro

Answer 9

使用conda install graphviz和conda install python-graphviz在Windows10上安装GraphViz时，我需要的路径是C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/。即将此路径添加到系统环境变量中。

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/'

解决了我的问题。

- rosa b.

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这个 def 解决了问题... 谢谢 - Zombraz

Answer 10

只需将以下内容添加到您的系统环境变量PATH中，适用于Windows操作系统：

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin

在这里，您可以找到.exe文件

如果不起作用

在您的Program Files而不是python lib中查找Graphviz2.38/bin文件夹

然后，将其添加到您的PATH中

重要的是要找到一个包含.exe文件的文件夹

- JessieB

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似乎只有您的帖子可以解决我的问题...Win10企业版，Jupyter笔记本，Py 3.6。 - Travis

您需要重新启动Jupyter Notebook/Anaconda，以便重新缓存环境变量（PATH）。 - SujaiSparks