将Python数据框写入R数据格式

Question

我是一名有用的助手，可以为您翻译文本。

我在写入dataframe格式到R时遇到了问题。

我有1000列X 77行数据。我想将这个dataframe写入R数据中。

当我使用函数

r_dataframe = com.convert_to_r_dataframe(df)

我遇到了一个错误，提示 dataframe 对象没有 type 属性。

当我查看 com.convert_to_r_dataframe() 的代码时，发现它只是获取了 dataframe 的列，并获取了列的 dtype.type。此时，这列是 dataframe，我认为大型列 dataframe 中可能包含内部 dataframe？有没有人有解决这个问题的想法？

- xiangjian Wu

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feather包可能会有所帮助：https://blog.rstudio.org/2016/03/29/feather/这是一种Python和R都可以读取的格式。 - Rentrop

@Floo0 谢谢您的评论。但是，我无法修改 R 数据服务器。我只能使用 Python 将其保存为 R。 - xiangjian Wu

Feather 目前也不支持稀疏数据框。 - Ben Whale

Answer 1

使用feather格式可以将数据帧从Python转移到R。您可以通过此链接找到更多信息。

快速示例。

在Python中导出：

import feather
path = 'my_data.feather'
feather.write_dataframe(df, path)

在 R 中导入：

library(feather)
path <- "my_data.feather"
df <- read_feather(path)

在这种情况下，您将获得R中的数据框。然后，您可以决定将其写入RData文件。

save(df, file = 'my_data.RData')

- takje

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谢谢你的帮助。但我认为这不是最佳实现方式。 - xiangjian Wu

AttributeError: 模块 'feather' 没有 'write_dataframe' 属性。 - Jas

pip install feather-format # 解决上述 AttributeError 信息 - Jas

Answer 2

最简单、最好的实际解决方案是以 csv 格式导出。

import pandas as pd

dataframe.to_csv('mypath/file.csv')

然后使用 read.csv 在 R 中读取。

- ℕʘʘḆḽḘ

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Python的输出必须是Rdata格式。我只是将数据框保存为csv文件，然后使用pd.read_csv()读取它，但它仍然存在相同的问题。 - xiangjian Wu

请查看以下内容：https://dev59.com/dGUp5IYBdhLWcg3wvpYM - ℕʘʘḆḽḘ

有很多充分的理由说明这并不是“最简单、最好”的方法，但如果你要做出超级lative的声明，就要准备好证明它。to_csv可能会非常慢，但更重要的是，不总是需要转到CSV，然后再从CSV重新导入。拥有一条更直接的路线到达目的地会很有帮助。 - Michael Tuchman

不回答原帖作者提问 - dawid