如何向Pandas DataFrame添加表头行

Question

我正在使用pandas将一个csv文件读入。这个csv文件由四列和若干行组成，但是没有标题行，我想添加一个标题行。我一直在尝试以下操作：

Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t')
Frame = pd.DataFrame([Cov], columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])
Frame.to_csv("path/to/file.txt", sep='\t')

但是当我应用这段代码时，出现以下错误：

ValueError: Shape of passed values is (1, 1), indices imply (4, 1)

这个错误具体是什么意思？在Python中，如何干净地给我的csv文件/ pandas df添加标题行？

- sequence_hard

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这是对您问题的不同解释：添加另一个标题到现有数据框以创建MultiIndex。 - cs95

Answer 1

您可以直接在read_csv中使用names。

names：类似数组，默认为无。要使用的列名称列表。如果文件没有标题行，则应显式传递header=None。

Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", 
                  sep='\t', 
                  names=["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])

- Leb

Answer 2

或者您可以使用“header=None”读取您的csv文件，然后使用“df.columns”添加它：

Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t', header=None)
Cov.columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]

- Anton Protopopov

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代码很好 - 但我发现在一个空数据框上它不起作用。在这种情况下，Python会抛出“ValueError: Length mismatch: Expected axis has 0 elements, new values have ... elements”。你可能需要像https://dev59.com/YFcP5IYBdhLWcg3wXI3Z这样的东西。 - Alexandre Jean

Answer 3

col_Names=["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]
my_CSV_File= pd.read_csv("yourCSVFile.csv",names=col_Names)

完成此操作后，只需使用以下命令进行检查：

my_CSV_File.head()

- Bhardwaj Joshi

Answer 4

简单易行的解决方案：

import pandas as pd

df = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t')
headers =  ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]
df.columns = headers

注意：请确保您的标题长度与CSV文件的标题长度匹配。

- Shoaib Muhammad Arif

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我为你鼓掌，因为你是唯一一个实际回答问题而不是建议首先避免问题的人。 - KansaiRobot

我认为这个解决方案存在问题。在读取CSV文件后，第一行被声明为列。因此，当您使用“headers”列表重新声明列时，您并没有添加新行，而是用标题列表替换了第一行（已声明为标题）。因此，您最终会删除字面上的第一行数据。 - Reincoder

Answer 5

为了修复你的代码，你可以简单地将[Cov]更改为Cov.values，pd.DataFrame的第一个参数将变成多维numpy数组。

Cov = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep='\t')
Frame=pd.DataFrame(Cov.values, columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"])
Frame.to_csv("path/to/file.txt", sep='\t')

但最聪明的解决方案仍然是使用pd.read_excel，并使用header=None和names=columns_list。

- romulomadu

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当我们提供列列表时，是否可以为所选列添加默认值？ - YoungSheldon

Answer 6

当读取没有标题的文件时，现有的答案正确地指出header=参数应设置为None，但没有解释原因。这是因为默认情况下，header=0，这意味着文件的第一行被推断为标题。例如，以下代码使用col_names覆盖了第一行，因为第一行被读取为标题并被col_names替换。

请注意，这里假定列由空格' '分隔。

col_names = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]
df = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep=' ')                   # <--- wrong
df.columns = col_names

为了获得正确的输出，您需要设置header=None:

df = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep=' ', header=None)      # <--- OK
df.columns = col_names

或者使用names=参数在一个函数调用中分配列名：

df = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep=' ', names=col_names)  # <--- OK

header=None 的方式通常更受欢迎，如果列数未知（因为 len(col_names) 必须等于从文件推断出的列数），或者特定的列名不重要。例如，在调用 read_csv 后调用 add_prefix() 可以向默认列名添加前缀：

df = pd.read_csv("path/to/file.txt", sep=' ', header=None).add_prefix('col')

- cottontail

Answer 7

由于提到我们正在从csv文件中读取，因此分隔符应为','[默认情况下，无需提及]，并且给定的文件没有标题，因此使用header=None`

示例代码：

import pandas as pd
data = pd.read_csv('path/to/file.txt',header=None)
data.columns = ["Sequence", "Start", "End", "Coverage"]
print(data.head()) #Print the first rows

- user3636989