DICOM基础知识——体积数据

Question

我查阅了DICOM标准和维基百科页面（以及所有SO上的DICOM主题），但是没有深入挖掘文件结构文档（呃），我不清楚由3D/4D/5D数据组成的扫描在DICOM文件中到底存储了什么。我只想要一个概述。

以MRI为例，DICOM文件包含以下哪些内容？

1. 从各个角度拍摄的原始2D图像集合 2. 形成3D体素数据集的切片堆叠 3. 完整的3D数据集

换句话说，DICOM是否包含对影像机捕捉的原始图像进行任何后处理？

至于4D，可能它只是多个3D数据集的集合，每个“帧”都是单独的数据集？

- Mr. Boy

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+1 我看到你问题中第一点和你在物理学SE上的帖子之间的联系了 - (1) 适用于CT扫描。 - Antoni Parellada

Answer 1

DICOM“标准”有许多不同的选项和供应商扩展，因此大多数事情都是可能的。话虽如此，我遇到的大多数3D DICOM数据集都是2D图像堆栈。对于后处理，它完全取决于成像机器。如果您正在寻找免费的DICOM库，可以尝试使用GDCM，我对它还算满意。

- tkerwin

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+1 是的，它几乎是标准的，但并不完全相同。 - Dr. belisarius

我看了一下GDCM，但是我有些不太明白它支持和不支持什么。那么本质上，我可以通常期望一组单独的JPG图像？ - Mr. Boy

基本上是这样的。问题在于经常会有多个堆栈被转储到同一个目录中，但文件名又不太有用。你需要使用标签（系列、图像位置等）来确定哪些数据应该放在哪里。 - tkerwin

Answer 2

原始的DICOM MR格式仅包含一张2D图像。这种格式仍然被广泛支持，很可能是您所拥有的格式。如果是这种情况，那么您需要收集所有系列中的图像来构建您的体积。

较新的增强MR图像格式能够将整个体积存储为多帧图像。如果是这种情况，那么这就是您的体积。我不记得一个单独的增强MR对象是否必须是整个系列还是不是。

您可以通过查看DICOM属性SOP Class UID（0008,0016）来区分它们：

 Original MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4   
 Enhanced MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

在上文中，当我说你可能需要收集“一系列图像”来构建一个卷时，这意味着你正在使用具有相同的属性系列实例UID（0020,000E）值的图像。

注：

• DICOM 纯粹主义者更喜欢使用“图像信息对象定义”这个术语，而不是我一直在使用的“格式”这个词。
• DICOM 纯粹主义者会反对说 SOP 类 UID 定义了图像格式。但就你的目的而言，它可以工作。

- Dan Konigsbach