验证DICOM文件

Question

我需要从文件夹中挑选出所有有效的DICOM文件。我可以递归地从具有*.DCM扩展名的文件夹中选择所有文件。但是，任何带有*.DCM扩展名的文件都会被选择，而这样的文件并不是有效的DICOM文件。

最好的方法是什么？

我考虑读取文件的几个字节并进行验证。

或者

其他方法或我们拥有的任何其他EXE进行验证。

谢谢， Harsha

编辑：问题的解决方案： 我最终使用了dcmftest.exe进行验证。希望我走在正确的轨道上。 -Harsha

- Harsha

Answer 1

您想识别DICOM文件，而不是验证。两者之间存在很大的区别。验证至少意味着其SOP类所需的所有标签都存在。

识别很容易，因为DICOM文件必须在偏移量0x80处包含文本“ DICM”，因此标签从文件的偏移量0x84开始。

请注意，有时仅存储序列化数据集（从文件偏移量0开始的标签组8），这些更难识别，但不是标准。

编辑：以RAR归档为例。它很容易被识别，因为它以 “Rar！”开头。但是，要确定它是有效的RAR归档，您必须解压缩所有文件并检查它们的CRC，而这只能由RAR本身完成（并且很慢）。

- ruslik

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识别并不容易！有些DICOM文件没有前导和魔数。 - phuclv

Answer 2

我知道这个问题已经有答案了，但是我有类似的需求，所以我编写了一些扩展方法来完成这个任务。它可以处理文件、文件流、内存流和通用流。只读取需要验证文件类型的特定4个字节。非常高效，我能够在几秒钟内浏览数千个文件。

C#

public static class Dicom
{
    public static bool IsDicomFile(this Stream s)
    {
        //Create an empty 4 byte array
        byte[] dba = new byte[4];

        //Seek to 0x80
        s.Seek(128, SeekOrigin.Begin);

        //Read the following 4 dba
        s.Read(dba, 0, 4);

        //Compare to 'DICM'
        return dba.SequenceEqual(new byte[4] {68, 73, 67, 77});
    }

    public static bool IsDicomFile(this MemoryStream ms)
    {
        return ((Stream)ms).IsDicomFile();
    }

    public static bool IsDicomFile(this FileStream fs)
    {
        return ((Stream)fs).IsDicomFile();
    }

    public static bool IsDicomFile(this FileInfo fi)
    {
        return fi.OpenRead().IsDicomFile();
    }
}

VB.NET

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal s As Stream) As Boolean
    'Create an empty 4 byte array
    Dim dba() As Byte = New Byte(3) {}

    'Seek to 0x80
    s.Seek(128, SeekOrigin.Begin)

    'Read the subsequent 4 bytes
    s.Read(dba, 0, 4)

    'Compare to 'DICM'
    Return dba.SequenceEqual(New Byte(3) {68, 73, 67, 77})
End Function

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal ms As MemoryStream) As Boolean
    Return DirectCast(ms, Stream).IsDicomFile
End Function

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal fs As FileStream) As Boolean
    Return DirectCast(fs, Stream).IsDicomFile
End Function

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal fi As FileInfo) As Boolean
    Return fi.OpenRead().IsDicomFile
End Function

- Philmatic

Answer 3

请注意，扩展名为.dcm的文件并不是真正合法的DICOM格式，尽管出于遗留原因，编写程序以接受这些文件仍然是一个好主意（但您不应该在应用程序导出的DICOM文件上放置3个字符的文件名扩展名）。根据DICOM标准有关媒体交换的部分，“不得使用ISO 9660文件名扩展名”。此外，除了标准的第10和12部分中描述的特殊DICOMDIR文件之外，不应从文件名或目录结构中推断任何语义。

ruslik的答案给出了识别DICOM文件的正确方法。如果文件前导中指定位置有DICM，则它是DICOM文件。否则，它不是。

- Matt

Answer 4

考虑到不同IOD中存在不同的强制和可选标签，验证DICOM文件并不是一项容易的任务。我认为最好使用现有的解决方案来完成这项工作。您可以查看DCMTK中的DCMCHECK（http://dicom.offis.de/dcmcheck.php.en）来实现。

- Naveen

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DCMCHECK模块不是免费提供的，必须单独获得许可证。 - Andrei Krasutski

这个链接页面给我返回了404错误。 - lnogueir

Answer 5

针对Java用户 dcm4che-tool-dcmvalidate 用法： dcmvalidate --iod [..][..] 这是一个实用工具，可以根据指定的信息对象定义（Information Object Definition）验证DICOM对象。 - 选项： -h,--help 显示此帮助并退出 --iod xml文件的路径，其中包含信息对象定义 -V,--version 输出版本信息并退出 示例： $ dcmvalidate --iod etc/dcmvalidate/dicomdir-iod.xml DICOMDIR

根据etc/dcmvalidate/dicomdir.xml中指定的IOD验证DICOMDIR。 点击此处获取更多参考信息

- Jay Thakkar

Answer 6

注意：检查“DICM”的前导内容仅检查文件是否为DICOM v3文件。早期版本的DICOM没有前导内容。可以查看所有必需的DICOM标签等，并可导入DICOM节点的100％有效的DICOM文件没有前导内容。

我正在与OFFIS联系，以了解经许可的DCMCHECK版本是否也具有此限制，但尚未收到他们的回复。

- bnoeafk