假设我有一个文件夹里的.dicom文件序列，其累计大小约为100 Mb。这是很多数据。我尝试将数据转换为.nrrd和.nii格式，但这些文件的总大小与转换后的.dicom文件相同（这是可以预测的，尽管.nrrd使用gzip进行压缩）。我想知道是否有一种文件格式可以让我获得更小的文件大小，或者仅仅解决问题的方法。也许使用.vtk格式或其他格式可以解决问题（不确定是否可行）。提前感谢。
有没有一种压缩DICOM数据的方法？
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- John Doe
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严格解释，“100MB”意味着对于熟悉相关标准的人来说是“一百毫比特”，这在任何人看来都不是很大的数据量。如果你实际上指的是“一百兆比特”甚至是“一百兆字节”，我们中的许多人仍然会认为，“嗯，实际上并不是很多数据”。最后，这里有一个可能会真正有所帮助的参考资料http://www.mccauslandcenter.sc.edu/mricro/dicom/index.html - High Performance Mark
@HighPerformanceMark 那并没有帮助，但感谢您提到了这一点，我已经编辑了问题。 - John Doe
1个回答
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DICOM支持在文件本身内压缩像素数据。DICOM的核心思想是，从像素数据的角度来看，它与格式无关。
DICOM可以保存原始像素数据和JPEG压缩像素数据，以及许多其他格式。DICOM文件的传输语法标签给出了DICOM中像素数据的压缩协议。
首先要确定是否需要无损或有损压缩。如果是有损的话，有很多选择，某些情况下压缩比相当高 - 折衷的是，您会失去保真度，图像可能不适合诊断目的。还有一些无损压缩方案 - 如JPEG2000，RLE甚至是JPEG-LS。这些将压缩像素数据，但保留诊断质量，没有任何图像退化。
您也可以对文件进行压缩，如果是原始数据，则应该产生非常好的结果。您要对这些压缩的DICOM执行什么操作？
DICOM可以保存原始像素数据和JPEG压缩像素数据，以及许多其他格式。DICOM文件的传输语法标签给出了DICOM中像素数据的压缩协议。
首先要确定是否需要无损或有损压缩。如果是有损的话，有很多选择，某些情况下压缩比相当高 - 折衷的是，您会失去保真度，图像可能不适合诊断目的。还有一些无损压缩方案 - 如JPEG2000，RLE甚至是JPEG-LS。这些将压缩像素数据，但保留诊断质量，没有任何图像退化。
您也可以对文件进行压缩，如果是原始数据，则应该产生非常好的结果。您要对这些压缩的DICOM执行什么操作？
- Anatoly G
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感谢您提供的出色答案。我原本打算在Web应用程序中使用文件，但决定部分使用这些数据。 - John Doe
如果您将它们用于Web应用程序，您可能只想从DICOM中提取图像数据并将该数据保存为JPEG。 DCMTK工具包（http://dicom.offis.de/dcmtk.php.en）非常支持从DICOM中提取图像数据到JPEG（甚至有一个命令行实用程序来执行此操作）。 - Anatoly G
好的，我很乐意帮忙，但这是一个三维可视化 :) - John Doe
啊，你需要生成一个网格。我相信你可以使用Pixelmed（http://www.pixelmed.com）库来帮助你完成这个任务。 - Anatoly G
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