加载plyr包时出现问题

Question

我使用 R 2.13.1，尝试在 R 中加载“plyr 1.6”包但未成功。我已将其手动安装到目录“~/R/library”中。 我的代码是：

.libPaths("~/R/library")
 library(plyr)

我得到了以下信息：

在运行library(plyr)时出现错误：'plyr'不是一个有效的已安装包。

使用其他软件包（"chron"，"zoo"，"ismev"，"Lmoments"）都能正常工作，但对于软件包“plyr”却不行，并且我不知道发生了什么。我尝试过安装和加载较早版本的“plyr”，但结果相同。

由于我被卡住了，非常感谢任何帮助！ 敬礼 Sisse

- Sisse Camilla Lundholm

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你已经采取了哪些“手动安装”软件包的步骤？无论如何，从CRAN安装有什么问题吗？我认为这也确保了plyr所依赖的必要软件包已经被安装... - Nick Sabbe

.libPaths() 返回什么？installed.packages()["plyr",] 呢？ - Brian Diggs

我下载了.tar.gz文件并解压缩。当我使用“install.packages（“package”）”时，我收到以下消息：警告：无法访问存储库http://mirrors/dotsrc.org/cran/src/contrib的索引。 - Sisse Camilla Lundholm

.libPaths() 返回："/home/scl/R/library" "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/library"。"installed.packages()["plyr"]" 返回 NA。所以，我猜它甚至没有被安装。 - Sisse Camilla Lundholm

你提供的 install.packages("plyr") 的错误信息表明你的镜像站点设置有误。正确的应该是 mirrors.dotsrc.org/cran，而不是 mirrors/dotsrc.org/cran。最简单的设置镜像的方法是使用 chooseCRANmirror()。并且你是对的，plyr 还没有被安装，因为 installed.packages()["plyr",] 的结果显示如此（你确实在方括号内包含了逗号，对吗？） - Brian Diggs

是的，那当然是个好点子。我已经在 /etc/apt/sources.list 文件中把错误的句号改成了斜杠。非常感谢你的帮助！经过 10 小时的工作，我现在只能等到明天才能看看它是否奏效。 - Sisse Camilla Lundholm

Answer 1

这不是手动安装 plyr 的答案，而是关于为什么你首先需要手动安装的答案。

我怀疑你的 CRAN 镜像设置不正确。要检查，请键入

options("repos")[[1]][1]

这应该返回类似以下内容：

> options("repos")[[1]][1]
                                    CRAN 
"http://streaming.stat.iastate.edu/CRAN" 
> 

尝试将您的仓库设置为不同的镜像，例如： options(repos="http://streaming.stat.iastate.edu/CRAN") 或使用其他镜像。

然后尝试加载plyr。

install.packages("plyr")
library("plyr") 

并且让我们知道发生了什么。

- JD Long

Answer 2

您可能需要查看?install.packages。它使从CRAN安装软件包变得非常简单。就像install.packages(pkgs="plyr")一样简单。

- Nick Sabbe

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这基本上是与Hadley在manipulatr列表@googlegroups.com上发布的问题相同的建议。 - IRTFM

Answer 3

解包 tar.gz 文件只适用于仅包含 R 代码的软件包。 plyr 使用外部代码，如果仅将源文件提取到库中，则不会编译该代码。

使用 install.packages 和参数 repos = NULL 来安装源文件。

install.packages("path/to/the/file/plyr_1.6.tar.gz", repos = NULL)

长期来看，解决您的互联网问题是最好的解决方案。如果您使用的是企业网络，请与网络管理员联系，因为他们可能正在阻止流量。

- Richie Cotton

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我曾经遇到过另一个R包的类似问题。我必须添加type="source"才能使它工作'install.packages("D:/xyz.tar.gz", type="source",repos = NULL)'。 - user131476