我能否让R plyr包默认并行工作？

Question

我正在进行类似以下内容的分析：

library(plyr)
input.files <- c("file1.txt", "file2.txt", "file3.txt")
input.data <- llply(input.files, load.file, .parallel=TRUE)
step.one.results <- llply(input.data, step.one, .parallel=TRUE)
step.two.results <- llply(step.one.results, step.two, .parallel=TRUE)
...
step.N.results <- llply(`step.N-1.results`, step.N, .parallel=TRUE)
...

有没有什么办法可以默认使所有的plyr函数同时运行，这样我就不用在每一步中都指定.parallel=TRUE了吗？

- Ryan C. Thompson

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除了下面的解决方案之外，似乎diversitree包中有一个名为set.defaults的函数可以实现这个功能。 - Jake Fisher

Answer 1

library(Defaults)
setDefaults(llply, .parallel=TRUE)

如果您想更改默认参数，需要对每个函数都进行setDefaults设置。如果您希望可以将其放入.Rprofile中。

您也可以直接更改参数。例如：formals(llply)$.parallel <- TRUE 可以起作用。

- GSee

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只是提供信息，看起来Defaults包在CRAN上不再可用，所以您必须直接处理formals。 - Jake Fisher

Answer 2

以下是我对另一个问题的回答：

由于Defaults包已不再在CRAN上提供，您可以使用default。

例如：

x <- list(a = 1, b = 2, c = 3)
default::default(unlist) <- list(use.names = FALSE)
unlist(x)
#> [1] 1 2 3

unlist <- default::reset_default(unlist)
unlist(x)
#> a b c 
#> 1 2 3

这段文字是由reprex包（v0.2.0.9000）于2019年3月22日创建的。

- Alain Danet

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感谢您的回答！不幸的是，stack overflow的政策是即使链接被删除，答案也应该提供解决方案。请相应地编辑您的问题，或使用评论代替。谢谢！ - Nino Filiu

谢谢！根据您的要求，我已经懒惰地从相关问题中复制了我的答案。这样正确吗？ - Alain Danet

没问题！只要你的回答即使没有链接也能让人理解，就可以。 - Nino Filiu