在FindCorrelation中需要R和TRUE/FALSE。

Question

我在R中创建了一个简单的相关矩阵，并尝试使用caret进行特征选择，以便我可以删除高度相关的X属性。

这是我的代码：

highlyCorrelated <- findCorrelation(correlationMatrix, cutoff = 0.90, verbose = FALSE, names = TRUE, exact = ncol(correlationMatrix) < 100)

• highlyCorrelated是新对象的名称
• correlationMatrix是我的相关矩阵的名称

无论我如何将函数输入到R中，我都会收到以下错误。即使我只使用一个参数，我仍然会收到此错误：

Error in if (x[i, j] > cutoff) { : missing value where TRUE/FALSE needed

有什么想法吗？

- DataGuy

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在错误发生后打印出 i 和 j 的值，并检查 x[i,j] 的值。 - tushaR

当尝试打印时，i和j都不是对象，因此无法找到。 - DataGuy

你的相关矩阵是否有缺失值？ - user20650

没有缺失值。 - DataGuy

@user20650 是正确的，我的矩阵中有NA值。谢谢！ - DataGuy

Answer 1

我曾经遇到过同样的问题，@user20650的答案是正确的。我总是做同样的“预处理”来确保finCorrelation能够正常工作：

nums <- sapply(data, is.numeric)
data.numeric <- data[ , nums]

data.without_na <- na.omit(data.numeric)
cor_matrix <- cor(data.without_na)

findCorrelation(cor_matrix, 0.7)

- mjimcua

Answer 2

我曾经遇到过同样的问题。在我的情况下，问题出在数据中存在无限值，而use='complete.obs'在cor()函数中没有考虑到这一点。

通过对数据进行预处理，我解决了这个问题。

data <- apply(data, 2, function(y) {y[!is.finite(y)]=NA; y})

- Alex Gracian