我将在提供的数据上拟合模型,该数据来源于这个优秀示例,示例展示了如何在执行逻辑回归后计算响应的95%置信区间:
foo <- mtcars[,c("mpg","vs")]; names(foo) <- c("x","y")
mod <- glm(y ~ x, data = foo, family = binomial)
preddata <- with(foo, data.frame(x = seq(min(x), max(x), length = 100)))
preds <- predict(mod, newdata = preddata, type = "link", se.fit = TRUE)
critval <- 1.96 ## approx 95% CI
upr <- preds$fit + (critval * preds$se.fit)
lwr <- preds$fit - (critval * preds$se.fit)
fit <- preds$fit
fit2 <- mod$family$linkinv(fit)
upr2 <- mod$family$linkinv(upr)
lwr2 <- mod$family$linkinv(lwr)
现在,我的问题是您是否可以直接获得响应,只需请求即可。
predict(..., type = 'response', se.fit = TRUE)
不进行转换
predict(..., type = 'link', se.fit = TRUE)
然而,这会产生不同的标准误差。这些误差是什么,它们能直接用于计算拟合响应值的置信区间吗?在predict.glm中相关的代码如下:
switch(type, response = {
se.fit <- se.fit * abs(family(object)$mu.eta(fit))
fit <- family(object)$linkinv(fit)
}, link = , terms = )
并且进行输出比较:
preds_2 <- predict(mod, newdata = preddata, type = "response", se.fit = TRUE)
> head(preds_2$fit)
1 2 3 4 5 6
0.01265744 0.01399994 0.01548261 0.01711957 0.01892627 0.02091959
> head(preds_2$se.fit)
1 2 3 4 5 6
0.01944681 0.02098841 0.02263473 0.02439022 0.02625902 0.02824491
从上面的内容到下面的内容似乎并不是非常明显:
> head(fit2)
1 2 3 4 5 6
0.01265744 0.01399994 0.01548261 0.01711957 0.01892627 0.02091959
> head(upr2)
1 2 3 4 5 6
0.2130169 0.2184891 0.2240952 0.2298393 0.2357256 0.2417589
> head(lwr2)
1 2 3 4 5 6
0.0006067975 0.0007205942 0.0008555502 0.0010155472 0.0012051633 0.0014297930
?predict.glm
的文档中。 - Alex