Python - 使用点列表从网格化的NetCDF中提取数据,无需使用for循环

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以下示例使用东向风的“Unidata”样本netCDF数据集,该数据集可从此处下载(2.8 MB)。
我有两个整数列表,对应于netCDF文件中网格化数组的x和y索引。我想提取数据并将其保存到每个点组合的一维数组或列表中(例如,点:[(x[0],y[0]), (x[1],y[1]), (x[2],y[2]),...,(x[n],y[n])])。
我可以使用以下方法轻松完成此操作...
from netCDF4 import Dataset

# grid point lists
lat = [20, 45, 56, 67, 88, 98, 115]
lon = [32, 38, 48, 58, 87, 92, 143]

# open netCDF file
nc_file = "./sresa1b_ncar_ccsm3-example.nc"
fh = Dataset(nc_file, mode='r')

# extract variable
point_list = zip(lat,lon)
ua_list = []
for i, j in point_list:
    ua_list.append(fh.variables['ua'][0,16,i,j])

print(ua_list)

这返回:

[59.29171, 17.413916, -4.4006901, -11.15424, -5.2684789, 2.1235929, -6.134573]

然而,当处理大型数据集时,append() 运行缓慢。因此我尝试提高代码速度,不使用for循环而是希望在一行中返回结果。我尝试了以下代码:

# extract variable
ua_array = fh.variables['ua'][0,16,lat,lon]
print(ua_array)

它返回了每个可能的点组合,而不仅仅是我需要的那些:

[[ 59.2917099   60.3418541   61.81352234  62.66215515  60.6419754 60.00745392  52.48550797]
[ 18.80122566  17.41391563  14.83201313  12.67425823  13.99616718 14.4371767   14.12419605]
[ -5.56457043  -5.20643377  -4.40069008  -3.25902319  -2.36573601 -2.25667071  -1.0884304 ]
[-11.66207981 -11.46785831 -11.35252953 -11.15423965 -11.35271263 -11.55139542 -11.68573093]
[ -1.15064895  -1.52471519  -2.12152767  -2.67548943  -5.26847887 -5.79328251  -6.16713762]
[ -1.95770085  -0.56232995   0.82722098   1.39629912   2.65125418 2.12359285  -6.47501516]
[ -9.76508904 -10.13490105 -10.76805496 -11.31607246 -11.93865585 -11.56440639  -6.13457298]]

我该如何切割netCDF文件以便获取与上述代码相同的结果?谢谢。
1个回答

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首先使用016进行普通索引,然后再使用latlon进行高级索引:

ua_array = fh.variables['ua'][0,16][lat,lon]
print(ua_array)

输出:

[ 59.2917099   17.41391563  -4.40069008 -11.15423965  -5.26847887
   2.12359285  -6.13457298]

顺便提一下,ua_array 是一个NumPy数组。因此,调用它的 ua_list 名称有些误导。


非常感谢,@Mike。是的,你说得对,我应该把它们称为数组。我会编辑问题以供将来参考。干杯。 - Muon

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