从命令行运行R脚本并将结果存储在子目录中

Question

我希望能够在命令行（Linux系统）上运行一个R脚本，并将结果存储在工作目录的子目录中。操作步骤如下：

./myscript.r [param 1] [param 2] [param 3]

给定三个二项式参数，一共有四种条件。我想将每种条件的结果存储在工作目录的子目录中。

是否有一种优雅的方法来做到这一点，还是我真的需要将我的R脚本复制到每个子目录中？

- purcell

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你不能在R脚本中通过save, write.csv等方式处理吗？你可以使用system命令在R中创建新目录。 - tcash21

你能否在脚本内传递参数并让它写入每个目录？类似于为每个参数设置一个for循环的方式？ - Stedy

如果你的 R 程序将输出写入 stdout，只需将输出导向到相对于当前目录指定的文件即可。 - Alex A.

你应该包含一个最小代表性的程序示例，以提供更多关于你问题的上下文。 - nrussell

Answer 1

请尝试将此脚本保存并在您的计算机上运行。提供几种不同类型和组合的参数。

#!/usr/bin/Rscript
args <- commandArgs(TRUE)
print(args)
class(args)

例如，我运行了./test.R test=1 one=test命令。将此命令与paste0()语句结合使用，应该可以根据提供的参数定制输出位置。

- ebyerly