我正在处理多部分网络,特别是四部分网络。首先,在NetworkX中似乎只能通过nx.complete_multipartite_graph()处理完整的多部分网络,而不能处理更一般的多部分网络(如果我错了,请纠正我)。如果需要,我可以开始查看igraph或另一个Python包。
受James A. Foster's question的启发,我创建了一个类似于我的网络的绘图,当然规模要小一些,并且具有一些特征。我仅使用此代码以图形方式查看它,并作为帮助来解释我想做什么。
我使用以下命名法: 第一和第二列形成“X二分网络”, 第二和第三列形成“Y二分网络”, 第三和第四列形成“Z二分网络”, 我有所有这些网络在单独的文件中。我想将它们集成到一个多部分网络中,如下图所示:Quadripartite graph。
(1) 我应该如何进行?据我所知,我不能使用nx.compose()函数。
(2) 我该怎么办?我需要指定两列是不同的,尽管它们具有相同的元素。
(3) 我如何提取第一列和第四列之间的网络?在这个小网络中,例如,节点6与11和14相连,节点11当然与1、2和6相连。
受James A. Foster's question的启发,我创建了一个类似于我的网络的绘图,当然规模要小一些,并且具有一些特征。我仅使用此代码以图形方式查看它,并作为帮助来解释我想做什么。
我使用以下命名法: 第一和第二列形成“X二分网络”, 第二和第三列形成“Y二分网络”, 第三和第四列形成“Z二分网络”, 我有所有这些网络在单独的文件中。我想将它们集成到一个多部分网络中,如下图所示:Quadripartite graph。
(1) 我应该如何进行?据我所知,我不能使用nx.compose()函数。
(2) 我该怎么办?我需要指定两列是不同的,尽管它们具有相同的元素。
(3) 我如何提取第一列和第四列之间的网络?在这个小网络中,例如,节点6与11和14相连,节点11当然与1、2和6相连。
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
def position_QuadriPartiteGraph(Graph, Parts):
uPos = {}
vPos = {}
for index1, agentType in enumerate(Parts):
uPos[agentType] = index1
QG = nx.Graph()
QG.add_nodes_from([1,2,3,4,5,6,7], agentType='alfa')
QG.add_nodes_from(['a','b','c'], agentType='beta')
QG.add_nodes_from(['A','B','C','D','E','F'], agentType='gamma')
QG.add_nodes_from([8,9,10,11,12,13,14], agentType='delta')
myEdges = [(1,'a'), # beginning of bipartite network X
(1,'b'), # X
(2,'b'), # X
(3,'a'), # X
(4,'a'), # X
(5,'a'), # X
(6,'c'), # X
(7,'a'), # end of bipartite network X
('a','A'), # beginning of bipartite network Y
('a','B'), # Y
('a','E'), # Y
('b','B'), # Y
('b','C'), # Y
('b','D'), # Y
('c','F'), # end of bipartite network Y
('A',8), # beginning of bipartite network Z
('A',9), # Z
('B',9), # Z
('B',13), # Z
('C',10), # Z
('C',11), # Z
('C',12), # Z
('D',12), # Z
('E',13), # Z
('F', 11), # Z
('F', 14)] # end of bipartite network Z
[QG.add_edge(u, v) for u, v in myEdges]
nx.draw(QG, pos=position_QuadriPartiteGraph(QG, ['alfa', 'beta', 'gamma', 'delta']), with_labels=True)
plt.savefig("multipartite_graph.png")
plt.show()
提前感谢您的帮助,
Jorge