在R中使用pairs绘制散点图，数据包含零值，要使用对数比例尺。

Question

我想使用"pairs"函数绘制一些散点图。我的数据框如下：

    >e
    X Y Z
    0 0 0
    2 3 4
    0 3 4
    3 3 3

这里是完全标准的数据框。

我将其用于绘制散点图，没有什么花哨的东西：

pairs(~X+Y+Z, data=e, log="xy")

它的表现很好，但它不会绘制标签。然而，如果我在命令中删除log="xy"，那么标签就会被漂亮地绘制出来。所以我想这与我想让我的散点图处于对数刻度有关。

所以我的问题是我该怎么办？ 我应该提前删除所有包含零的行吗（如何做到这一点？） 是否有一个神奇的技巧可以让我拥有log="xy"和我的散点图标记？

请让我知道是否不清楚。

- Benoit B.

Answer 1

你忽略了这个（我在调用你的数据框时称其为DF）：

R> pairs(~X+Y+Z, data=df, log="xy")
There were 30 warnings (use warnings() to see them)

如果您查看这些30个警告，您会发现：

- 不能在对数坐标上绘制包含零的数据（我猜您知道原因） - log不是pairs()的一个已知参数

所以如果您想在对数坐标下进行配对绘图，您可能需要自己取对数（并且可以添加一个小的epsilon或使用像log(1 + x)这样的转换），然后对该数据调用pairs()。

编辑：最简单的方法可能是pairs(~X+Y+Z, data=log(1+DF))。

- Dirk Eddelbuettel

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这是一种奇怪的行为。它实际上在对数刻度上绘制数据，一切看起来都很好，只是省略了标签。使用plot(df, log="xy")也会出现类似的结果，其中log（大概？）是plot()的有效参数。 - Ken Williams

另外，不是要挑剔你的解决方案，因为它是我所知道的最好的，但是pairs(~X+Y+Z, data=log(1+DF))会不希望地改变轴标签为对数刻度。 - Ken Williams