绘制3D直方图/条形图

Question

我在scipy/numpy中有一个Nx3的矩阵，并且我想将其制作成一个三维柱状图，其中X轴和Y轴由矩阵的第一列和第二列的值确定，每个柱子的高度是矩阵的第三列，柱子的数量由N确定。

换句话说，如果“data”是这个矩阵:

data[:, 0] # values of X-axis
data[:, 1] # values of Y-axis
data[:, 2] # values of each Z-axis bar

对于每个len(data)，应该有一个条形图

我如何在Matplotlib中实现这个？

其次，作为这个的一种变体，我如何做相同的事情，但这一次将条形图分成每个X、Y、Z维度的N个bin？也就是说，不是针对每个数据点绘制条形图，而是将数据在每个维度上分成那些bin，并为每个bin绘制一个条形图。

- user248237

Answer 1

这是一个3D条形图的示例。 这里还有另一个示例。

Numpy有一个名为histogram2d的函数，用于进行矩形分箱。

- Paul

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我该如何为x、y和z轴添加标签？ - user248237

另外，当我使用ax.scatter制作3D散点图时，它会自动以alpha透明度绘制一些点--我该如何去除透明度并绘制所有点而不带透明度？ - user248237

Answer 2

我在处理数据的“高度”方面有些困难，但最终通过以下代码解决了问题。这里，Z是一个三维数组，包含了我的所有数据，而x和rval基本上是对应于数据点的二维索引。

xs = np.arange(biopsy_num)
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
for y in (np.arange(r_sweep)):
    z = Z[:,y]
    ax.bar(xs, z, zs=y, zdir='y', alpha=0.8)

ax.set_xlabel('biopsies')
ax.set_ylabel('radius of biopsy')
ax.set_zlabel('Shannon Index')

plt.show()

- cancerconnector