基于线宽，在networkx中绘制一个大型加权网络？

Question

如何使用networkx按边的粗细绘制超过1000个节点的加权网络？如果我有一个包含源节点、目标节点和每条边权重的.csv列表，并且我打算使用以下方法：

for i in range(N)
G.add_edge(source[i],target[i], weight=weight[i]) 
nx.draw_networkx_edges(G)

但是，我需要给每条边都设置厚度吗？还是只需给相似厚度的一组边设置厚度？

- user3298574

Answer 1

你可以单独指定每条边，或者如果有一些函数来计算分组，则可以将它们定义为组（然后使用多个draw_network_edges调用）。

这里有一个随机图的示例，它直接使用边权重作为边的粗细度，其次，使用数据作为颜色。

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
import numpy as np

n = 15; m = 40

# select some edge destinations
L = np.random.choice(xrange(n), 2*m)
# and suppose that each edge has a weight
weights = 0.5 + 5 * np.random.rand(m)

# create a graph object, add n nodes to it, and the edges
G = nx.DiGraph()
G.add_nodes_from(xrange(n))
for i, (fr, to) in enumerate(zip(L[1::2], L[::2])):
  G.add_edge(fr, to, weight=weights[i])

# use one of the edge properties to control line thickness
edgewidth = [ d['weight'] for (u,v,d) in G.edges(data=True)]

# layout
pos = nx.spring_layout(G, iterations=50)
#pos = nx.random_layout(G)

# rendering
plt.figure(1)
plt.subplot(211); plt.axis('off')
nx.draw_networkx_nodes(G, pos)
nx.draw_networkx_edges(G, pos, width=edgewidth,)

plt.subplot(212); plt.axis('off')

# rendering
nx.draw_networkx_nodes(G, pos)
nx.draw_networkx_edges(G, pos, edge_color=edgewidth)

plt.show()

这将使您得到类似于此的内容：

显然，您可以使用更复杂的函数来组装edgewidth值列表，以适合您的应用程序（例如分箱值或不同属性的乘积）。

- Bonlenfum

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加上一个图例怎么样？ - FaCoffee