"sna"或"igraph": 为什么我对于无向图得到不同的度值？

Question

我正在使用R包“networkdata”中的网络进行基本网络分析。为此，我使用了“igraph”和“sna”两个软件包。然而，我发现，根据我所使用的软件包不同，描述性网络统计结果也会有所不同。虽然大多数变化不太严重，但我的无向图平均度数在从“sna”切换到“igraph”后减半了。

library(networkdata)
n_1 <- covert_28

library(igraph)
library(sna)

n_1_adjmat <- as_adjacency_matrix(n_1)
n_1_adjmat2 <- as.matrix(n_1_adjmat)

mean(sna::degree(n_1_adjmat2, cmode = "freeman")) # [1] 23.33333
mean(igraph::degree(n_1, mode = "all")) # [1] 11.66667

这在我的有向图中是不会发生的。在这里，无论使用"sna"还是"igraph"，我都会得到相同的结果。

这种现象有什么解释吗？如果有，有什么方法可以防止它发生？

提前感谢您！

- Edda

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将 gmode="graph" 添加到 sna 函数中。有关参数，请参见 ?sna::degree。 - user20650

Answer 1

这在sna::degree的文档中有解释。

一个顶点v的入度对应于顶点集合N^+(v)的基数， 其中N^+(v)={i in V(G) : (i,v) in E(G)}； 出度对应于顶点集合N^-(v)的基数， 其中N^-(v)={i in V(G) : (v,i) in E(G)}； 总度数（或“Freeman”度数）对应于|N^+(v)| + |N^-(v)|。

(请注意，对于简单图，

入度=出度=总度数/2.)

一个比你的例子更简单的例子可以让它更清晰易懂。

library(igraph)
library(sna)

g = make_ring(3)
plot(g)

AM = as.matrix(as_adjacency_matrix(g))
sna::degree(AM)
[1] 4 4 4

igraph::degree(g)
[1] 2 2 2

第一个顶点同时链接了第二个和第三个顶点。这些链接在入度计数和出度计数中都要算上，因此：
Freeman = in + out = 2 + 2 = 4
文档中的“注释”说明了这一点。

- G5W