在Nvidia TX1上使用TensorFlow

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你遇到了哪些错误? - kris
这是一个过程。我正在努力让Bazel 0.3.0编译R0.10版本。目前的难点是获取gRPC的arm64二进制文件 - 它可以构建,但无法通过测试或使bzael编译。另一方面,我已经成功使用Bazel 0.2.1并尝试构建R0.9版本。我已删除sparse_matmul.cc并应用了一个补丁以使CUDA8.0RC工作(包括CUDA_DATA_HALF更改等),现在它遇到了tensorflow/core/kernels/cwise_op_gpu_select.cu.cc(46)的问题。如果您也在处理此问题,我会在此发布进一步的更新。 - Dwight Crow
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我也尝试过但失败了。如果您能成功并记录下过程,那将是非常有益的。一个潜在的困难是Tensorflow和Jetpack都在快速且不同步地更新。例如,Tensorflow 0.11版本是在您发布这篇文章的同一天发布的。 - Novak
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@Novak - 不如 R0.11 好,但 R0.9 可以工作。将继续努力尝试更高版本,并在成功时更新答案。其中一些错误感觉只需要进行小的提交就可以使 TF 更易于平台访问。希望这可以帮到你! - Dwight Crow
2个回答

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在TX1上使用Bazel 0.2.1、CUDA 8.0、CUDNN5.1、L4T24.2和全新安装的JetPack 2.3,成功运行了TensorFlow R0.9。我已经使用BN、Sigmoid、ReLU等基本MLP、Conv和LSTM神经网络进行了测试,目前没有出现错误。我删除了sparse_matmul_op,其他编译应该是完全正常的。其中许多步骤直接来自MaxCuda的优秀博客,所以非常感谢他们的提供。
计划继续尝试R0.10/R0.11(gRPC二进制文件目前正在阻止Bazel 0.3.0),但在此之前想发布R0.9版本公式。如下:
首先获取Java。
sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/java
sudo apt-get update
sudo apt-get install oracle-java8-installer

安装其他依赖项。
sudo apt-get install git zip unzip autoconf automake libtool curl zlib1g-dev maven swig

需要自己构建 protobuf 3.0.0-beta-2 的 jar 包。
git clone https://github.com/google/protobuf.git
cd protobuf
# autogen.sh downloads broken gmock.zip in d5fb408d
git checkout master
./autogen.sh
git checkout d5fb408d
./configure --prefix=/usr
make -j 4
sudo make install
cd java
mvn package

下载Bazel。我们需要0.2.1版本,与0.3.0不同,它不需要gRPC二进制文件,而我无法构建0.3.0版本(也许很快就可以了!)

git clone https://github.com/bazelbuild/bazel.git
cd bazel
git checkout 0.2.1
cp /usr/bin/protoc third_party/protobuf/protoc-linux-arm32.exe
cp ../protobuf/java/target/protobuf-java-3.0.0-beta-2.jar third_party/protobuf/protobuf-java-3.0.0-beta-1.jar

需要编辑一个bazel文件,以将aarch64识别为ARM。
--- a/src/main/java/com/google/devtools/build/lib/util/CPU.java
+++ b/src/main/java/com/google/devtools/build/lib/util/CPU.java
@@ -25,7 +25,7 @@ import java.util.Set;
 public enum CPU {
   X86_32("x86_32", ImmutableSet.of("i386", "i486", "i586", "i686", "i786", "x86")),
   X86_64("x86_64", ImmutableSet.of("amd64", "x86_64", "x64")),
-  ARM("arm", ImmutableSet.of("arm", "armv7l")),
+  ARM("arm", ImmutableSet.of("arm", "armv7l", "aarch64")),
   UNKNOWN("unknown", ImmutableSet.<String>of());

现在进行编译。
./compile.sh

并安装

sudo cp output/bazel /usr/local/bin

获取TensorFlow R0.9版本。高于R0.9版本需要使用Bazel 0.3.0,但由于gRPC问题,我尚未找到如何构建它。

git clone -b r0.9 https://github.com/tensorflow/tensorflow.git

只需构建一次。它可能会失败,但现在您有了bazel .cache目录,可以将更新的config.guess和config.sub文件放置在其中,以确定您正在运行的架构

./configure
bazel build -c opt --config=cuda //tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package

cd ~
wget -O config.guess 'http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.guess;hb=HEAD'
wget -O config.sub 'http://git.savannah.gnu.org/gitweb/?p=config.git;a=blob_plain;f=config.sub;hb=HEAD'

# below are commands I ran, yours will vary depending on .cache details. `find` is your friend
cp config.guess ./.cache/bazel/_bazel_socialh/742c01ff0765b098544431b60b1eed9f/external/farmhash_archive/farmhash-34c13ddfab0e35422f4c3979f360635a8c050260/config.guess
cp config.sub ./.cache/bazel/_bazel_socialh/742c01ff0765b098544431b60b1eed9f/external/farmhash_archive/farmhash-34c13ddfab0e35422f4c3979f360635a8c050260/config.sub
存在一些错误,我采取了懦弱的方式将其从构建中移除。
--- a/tensorflow/core/kernels/BUILD
+++ b/tensorflow/core/kernels/BUILD
@@ -985,7 +985,7 @@ tf_kernel_libraries(
         "reduction_ops",
         "segment_reduction_ops",
         "sequence_ops",
-        "sparse_matmul_op",
+        #DC "sparse_matmul_op",
     ],
     deps = [
         ":bounds_check",

--- a/tensorflow/python/BUILD
+++ b/tensorflow/python/BUILD
@@ -1110,7 +1110,7 @@ medium_kernel_test_list = glob([
     "kernel_tests/seq2seq_test.py",
     "kernel_tests/slice_op_test.py",
     "kernel_tests/sparse_ops_test.py",
-    "kernel_tests/sparse_matmul_op_test.py",
+    #DC "kernel_tests/sparse_matmul_op_test.py",
     "kernel_tests/sparse_tensor_dense_matmul_op_test.py",
 ])

在cwise_op_gpu_select.cu.cc中,TX1无法执行复杂的构造函数。

--- a/tensorflow/core/kernels/cwise_op_gpu_select.cu.cc
+++ b/tensorflow/core/kernels/cwise_op_gpu_select.cu.cc
@@ -43,8 +43,14 @@ struct BatchSelectFunctor<GPUDevice, T> {
     const int all_but_batch = then_flat_outer_dims.dimension(1);

 #if !defined(EIGEN_HAS_INDEX_LIST)
-    Eigen::array<int, 2> broadcast_dims{{ 1, all_but_batch }};
-    Eigen::Tensor<int, 2>::Dimensions reshape_dims{{ batch, 1 }};
+    //DC Eigen::array<int, 2> broadcast_dims{{ 1, all_but_batch }};
+    Eigen::array<int, 2> broadcast_dims;
+    broadcast_dims[0] = 1;
+    broadcast_dims[1] = all_but_batch;
+    //DC Eigen::Tensor<int, 2>::Dimensions reshape_dims{{ batch, 1 }};
+    Eigen::Tensor<int, 2>::Dimensions reshape_dims;
+    reshape_dims[0] = batch;
+    reshape_dims[1] = 1;
 #else
     Eigen::IndexList<Eigen::type2index<1>, int> broadcast_dims;
     broadcast_dims.set(1, all_but_batch);

在sparse_tensor_dense_matmul_op_gpu.cu.cc中同样如此。

--- a/tensorflow/core/kernels/sparse_tensor_dense_matmul_op_gpu.cu.cc
+++ b/tensorflow/core/kernels/sparse_tensor_dense_matmul_op_gpu.cu.cc
@@ -104,9 +104,17 @@ struct SparseTensorDenseMatMulFunctor<GPUDevice, T, ADJ_A, ADJ_B> {
     int n = (ADJ_B) ? b.dimension(0) : b.dimension(1);

 #if !defined(EIGEN_HAS_INDEX_LIST)
-    Eigen::Tensor<int, 2>::Dimensions matrix_1_by_nnz{{ 1, nnz }};
-    Eigen::array<int, 2> n_by_1{{ n, 1 }};
-    Eigen::array<int, 1> reduce_on_rows{{ 0 }};
+    //DC Eigen::Tensor<int, 2>::Dimensions matrix_1_by_nnz{{ 1, nnz }};
+    Eigen::Tensor<int, 2>::Dimensions matrix_1_by_nnz;
+    matrix_1_by_nnz[0] = 1;
+    matrix_1_by_nnz[1] = nnz;
+    //DC Eigen::array<int, 2> n_by_1{{ n, 1 }};
+    Eigen::array<int, 2> n_by_1;
+    n_by_1[0] = n;
+    n_by_1[1] = 1;
+    //DC Eigen::array<int, 1> reduce_on_rows{{ 0 }};
+    Eigen::array<int, 1> reduce_on_rows;
+    reduce_on_rows[0] = 0;
 #else
     Eigen::IndexList<Eigen::type2index<1>, int> matrix_1_by_nnz;
     matrix_1_by_nnz.set(1, nnz);

使用CUDA 8.0运行需要新的FP16宏。非常感谢Kashif/Mrry指出了修复方法!

--- a/tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_blas.cc
+++ b/tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_blas.cc
@@ -25,6 +25,12 @@ limitations under the License.
 #define EIGEN_HAS_CUDA_FP16
 #endif

+#if CUDA_VERSION >= 8000
+#define SE_CUDA_DATA_HALF CUDA_R_16F
+#else
+#define SE_CUDA_DATA_HALF CUBLAS_DATA_HALF
+#endif
+
 #include "tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_blas.h"

 #include <dlfcn.h>
@@ -1680,10 +1686,10 @@ bool CUDABlas::DoBlasGemm(
   return DoBlasInternal(
       dynload::cublasSgemmEx, stream, true /* = pointer_mode_host */,
       CUDABlasTranspose(transa), CUDABlasTranspose(transb), m, n, k, &alpha,
-      CUDAMemory(a), CUBLAS_DATA_HALF, lda,
-      CUDAMemory(b), CUBLAS_DATA_HALF, ldb,
+      CUDAMemory(a), SE_CUDA_DATA_HALF, lda,
+      CUDAMemory(b), SE_CUDA_DATA_HALF, ldb,
       &beta,
-      CUDAMemoryMutable(c), CUBLAS_DATA_HALF, ldc);
+      CUDAMemoryMutable(c), SE_CUDA_DATA_HALF, ldc);
 #else
   LOG(ERROR) << "fp16 sgemm is not implemented in this cuBLAS version "
              << "(need at least CUDA 7.5)";

最后,ARM处理器没有NUMA节点,因此需要添加该节点,否则在启动tf.Session()时将立即崩溃。
--- a/tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_gpu_executor.cc
+++ b/tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_gpu_executor.cc
@@ -888,6 +888,9 @@ CudaContext* CUDAExecutor::cuda_context() { return context_; }
 // For anything more complicated/prod-focused than this, you'll likely want to
 // turn to gsys' topology modeling.
 static int TryToReadNumaNode(const string &pci_bus_id, int device_ordinal) {
+  // DC - make this clever later. ARM has no NUMA node, just return 0
+  LOG(INFO) << "ARM has no NUMA node, hardcoding to return zero";
+  return 0;
 #if defined(__APPLE__)
   LOG(INFO) << "OS X does not support NUMA - returning NUMA node zero";
   return 0;

在这些更改之后,进行构建和安装!希望这对某些人有用。

在您的补丁中,是否有一种方法可以在TX1上编译“matrix_1_by_nnz.set(1, nnz);”?在TF 0.11或更高版本中,“.set”方法不起作用。 - joshsuihn

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按照Dwight的答案,创建至少6 GB的交换文件

遵循Dwight Crow的答案,使用8GB的交换文件并成功地运行以下命令,在Jetson TX1上从一个全新的JetPack 2.3安装中构建了TensorFlow 0.9:

bazel build -c opt --local_resources 3072,4.0,1.0 --verbose_failures --config=cuda //tensorflow/tools/pip_package:build_pip_package

我在TensorFlow的./configure脚本中使用了默认设置,只开启了GPU支持。

我的构建过程花费了至少6个小时。如果您使用SSD而不是USB驱动器,则速度会更快。

创建交换文件

# Create a swapfile for Ubuntu at the current directory location
fallocate -l *G swapfile
# List out the file
ls -lh swapfile
# Change permissions so that only root can use it
chmod 600 swapfile
# List out the file
ls -lh swapfile
# Set up the Linux swap area
mkswap swapfile
# Now start using the swapfile
sudo swapon swapfile
# Show that it's now being used
swapon -s

我用这个USB驱动器来存储我的交换文件。

我看到过的系统最多使用的内存是7.7 GB(在Mem上是3.8 GB,在Swap上是3.9 GB)。我使用free -h查看内存使用情况。曾经看到过同时使用的交换内存最多为4.4 GB。

创建pip软件包并安装

改编自TensorFlow文档:

$ bazel-bin/tensorflow/tools/pip_package/build_pip_package /tmp/tensorflow_pkg

# The name of the .whl file will depend on your platform.
$ pip install /tmp/tensorflow_pkg/tensorflow-0.9.0-py2-none-any.whl

致谢

感谢Dwight Crow(指南),elirex(bazel选项值和free -h),tylerfox(交换文件想法和local_resources选项),以及所有帮助过他们的人和Github问题线程中的每一个人。

交换文件脚本是从JetsonHack的gist改编而来。

未使用交换文件时收到的错误

为了帮助搜索引擎找到这个答案。

Error: unexpected EOF from Bazel server.

gcc: internal compiler error: Killed (program cc1plus)


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可以查看英文原文,
原文链接