OpenSlide.read_region函数存在问题吗？

Question

我正在使用openslide包的python API读取一些ndpi文件。当我使用read_region函数时，有时会返回奇怪的图像。可能出现了什么问题？

我尝试读取整个图像，并且它可以正常工作。因此，我认为原始文件没有问题。

from openslide import OpenSlide
import cv2
import numpy as np

slide = OpenSlide('/Users/xiaoying/django/ndpi-rest-api/slide/read/21814102D-PAS - 2018-05-28 17.18.24.ndpi')
image = slide.read_region((1, 0),6, (780, 960))
image.save('image1.png')

输出结果很奇怪output

- kinomoto-sakura

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有什么新消息吗？我遇到了完全相同的问题，而且只在大尺寸时出现。 - André Aichert

Answer 1

根据read_region文档所述，x和y参数始终处于0级坐标系中。为了实现您想要的行为，您需要将这些参数乘以您正在读取的级别的下采样率。

- Toya Teramoto

Answer 2

这似乎是一个与版本相关的错误，请参见

https://github.com/openslide/openslide/issues/291#issuecomment-722935212

问题似乎与libpixman版本0.38.x有关。 GunnarFarneback撰写了一个解决方法，建议首先加载不同的版本，例如：

export LD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpixman-1.so.0.34.0

更简单的更新解决方案是：

我们正在使用Python 3.6.8+，这对我们很有帮助：conda install pixman=0.36.0

- André Aichert

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当然，如果这是被接受的答案，那就太好了。除非你们对解决方案有任何疑问。 - André Aichert