如何在rmarkdown块中导入并运行Python文件？

Question

我有一个R Markdown文档和一个名为sim1.py的Python脚本。我想将Python代码导入代码块中。有时候我希望它运行，而有时候我只是想把代码粘贴在那里。

到目前为止，我尝试使用以下方式中的“child”代码块选项：

```{python, child=here::here("simulations", "sim1.py"), eval=FALSE}
```

我运行上述代码时没有收到错误信息，但是没有产生任何输出。

当我运行以下代码时

```{python, child=here::here("simulations", "sim1.py"), eval=TRUE}
```

我遇到了一个错误：

You can't use `macro parameter character #' in horizontal mode.
l.1938 #
        plt.savefig("test.pdf") 

错误信息指向注释行。

有没有想法同时做到：

• 仅显示代码
• 运行代码并显示代码和输出结果

编辑：我正在尝试的另一种选项是：

```{python sim-1, code=cat(readLines(sim_folder), sep = '\n'), eval=FALSE}
```

有意将文件内容读入、将其粘贴到代码块的正文中，并使用 Python 引擎进行求值。虽然在这种情况下，如果 eval=FALSE，则仅会将文件内容显示为有效的 Python 代码。这不会产生错误，但也不会显示任何内容。

- Scott White

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我以前从未使用过Python，但你是否查看了这里或这里？ - bretauv

是的，我已经检查过了。不完全符合我的需求。 - Scott White

我认为子文档也必须是Markdown文档... - hplieninger

我不确定。你可能是对的。 - Scott White

Answer 1

我差点就做到了！正确的解决方案在所有地方的文档中：https://yihui.org/knitr/options/#code-chunk

```{python sim-1, code=readLines(sim_folder), eval=FALSE}
```

- Scott White